基因计算

基因计算服务是阿里云基于容器Kubernetes技术面向生物行业用户提供的基因大数据计算服务,具有高效、弹性、可靠的优点,相比传统的基因计算过程速度更快,成本更低。

产品优势
使用方便,一条命令启动工作
无需搭建集群,开箱即用的加速API,使用专用的命令行工具,提交工作任务只需要一条命令。
速度快,比业界传统快30到120倍
高计算性能的基础设施结合分布式算法,完成任务速度比业界传统方式快30到120倍。
成本低,按量付费
按数据处理量一次性收费,没有其他额外费用,比业界传统方式更省成本。
云原生工作流
标准DAG工作流,以云原生容器平台ACK,大规模生产实践优化的DAG引擎为基础的生物信息工作流服务。

精心打造的功能

基因计算的无服务化API

AGS 加速服务,无需搭建集群,开箱即用的AGS 加速API。提供基因计算命令行和API,用户可通过命令行或者API创建计算任务WGS,WES,RNA等多种加速任务,无需购买和持有资源,以Pay As You Go模式来调用加速能力。

工作流生命周期管理

AGS工作流,以容器平台为基础的生物信息工作流服务,提供控制台界面帮助用户管理工作流,可查看工作流状态和事件、日志等信息,提供基因计算命令行和API,用户可通过命令行或者API创建计算工作流以及工作流生命周期管理。

领军客户实战场景

人类全基因组测序

人类外显子基因测序业务

人类基因组比对业务

宏基因组比对业务

人类肿瘤变异检测业务

人类全基因组测序业务
企业在人类全基因组测序(WGS)等业务中,一般在线下IDC中完成。线下IDC资源扩容慢,无法应付业务的弹性,而且通常一个工作流需要用时30~40小时。容器服务基因计算以按需的方式提供计算资源,以高效的方式解决资源弹性问题,同时大幅提升计算效率,用时只需通常的1/30到1/120。
能够解决

全基因组数据分析

WGS的基因比对、排序、去重、变异检测全流程,相比经典流程BWA/GATK可加速120倍,比目前全球最快的FPGA/GPU方案仍能提速2~4倍。 通过分析个体基因序列的突变机制,可为遗传病检测、肿瘤筛查等提供有力支撑,未来将在临床医学和基因诊断方面发挥巨大作用。人类全基因组有约30亿个碱基对,一个30X的WGS测序数据量大约在100GB。AGS在计算速度、精准度、成本、易用性、与上游测序仪的整合度上具有极大优势,同时适用于DNA的SNP/INDEL以及CNV结构变异检测,以及DNA/RNA病毒检测等场景。

  • 人类全基因组测序

    人类全基因组测序

    企业在人类全基因组测序(WGS)等业务中,一般在线下IDC中完成。线下IDC资源扩容慢,无法应付业务的弹性,而且通常一个工作流需要用时30~40小时。容器服务基因计算以按需的方式提供计算资源,以高效的方式解决资源弹性问题,同时大幅提升计算效率,用时只需通常的1/30到1/120。

    • 全基因组数据分析

      WGS的基因比对、排序、去重、变异检测全流程,相比经典流程BWA/GATK可加速120倍,比目前全球最快的FPGA/GPU方案仍能提速2~4倍。 通过分析个体基因序列的突变机制,可为遗传病检测、肿瘤筛查等提供有力支撑,未来将在临床医学和基因诊断方面发挥巨大作用。人类全基因组有约30亿个碱基对,一个30X的WGS测序数据量大约在100GB。AGS在计算速度、精准度、成本、易用性、与上游测序仪的整合度上具有极大优势,同时适用于DNA的SNP/INDEL以及CNV结构变异检测,以及DNA/RNA病毒检测等场景。

  • 人类外显子基因测序业务
  • 人类基因组比对业务
  • 宏基因组比对业务
  • 人类肿瘤变异检测业务

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