CPFS并行文件存储
基因组测序数据组装 基因序列组装需要海量的并发计算作业，CPFS并行文件存储 提供高达百GB的访问带宽，可以满足成百上千个节点同时访问的需求，破除文件IO访问瓶颈，任务完成时间缩短到原来的50%。石油勘探业务分析 大量地质数据需要计算、...
快速入门概述
为快速了解如何使用BizWorks进行云原生应用建设，您可以通过示例项目和参考帮助文档进行实验，了解业务建模、应用开发和部署、能力上架、轻应用组装等主要过程。关于示例项目的内容，请参见 示例项目简介 和 示例项目的使用限制说明 等。...
轻应用概述
轻应用支持敏捷的应用低代码开发模式，能够基于已被中心应用构建完成的底层能力进行上层业务能力组装，并进一步开发上层前端应用，实现对新业务诉求的迅速响应，并组装出上层页面或系统。轻应用的主要使用过程 创建轻应用。具体操作，请...
使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序
本文介绍如何使用E-HPC集群运行BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序计算。背景信息 生命科学领域内基因测序技术的飞速发展，人类发现的基因序列以指数级增长，对于如此数量庞大的基因进行同源性搜寻、比对、变异检查等，往往伴随着巨大的...
什么是云原生应用组装平台BizWorks
云原生应用组装平台BizWorks是基于组装式理念和阿里巴巴中台实践构建的一体化云原生应用开发和组装平台，提供了业务建模、微服务开发、轻应用组装、能力开放等平台功能，致力于帮助企业快速设计、构建、组装和运营可复用的业务能力组件和...
应用场景
典型应用场景包括基因数据分析、测序生产自动化和基因云平台开发等。基因数据分析 为任意规模用户，提供开箱即用的基因分析服务，效率高，成本低，灵活可靠，最快30分钟即可获取海量数据的计算结果。提供常用的生信流程和最佳参数配置，...
开发和管理自定义组件
步骤六：发布自定义组件（新增自定义组件）登录BizWorks，在 选择平台 下拉列表中选中 轻应用组装平台。单击页面右上角 图标或其文本框区域，在下拉列表中单击目标项目名称后，单击 应用 页签。在应用列表页面单击目标轻应用名称。在目标轻...
产品版本
不支持 不支持 支持 轻应用组装平台 页面编排 支持 支持 支持 组件编排 支持 支持 支持 资源管理 支持 支持 支持 服务编排 支持 支持 支持 数据源支持 部分支持 部分支持 支持 用户认证 支持 支持 支持 自定义扩展能力 部分支持 部分支持 ...
使用场景和主要概念
定位和使用场景 场景1：在BizWorks组装式架构中，为开发者提供一种BFF层（Backend For Frontend）的低代码实现方式，从而快速进行接口的服务编排和组装。场景2：客户现有业务应用如需接入到BizWorks体系中进行统一运营，但尚未完成微服务...
创建和管理项目域名
添加项目域名 登录BizWorks，在 选择平台 下拉列表中选中目标平台：微服务开发平台 或 轻应用组装平台。单击页面右上角的 图标或其文本框区域，在下拉列表中单击目标项目名称后，在平台顶部导航栏单击 运维 页签。在 运维 导航栏中，单击 ...
利用实体批量投递运行任务
name：应用的名字 reads_group:测序数据所属的reads group FASTQ1：样本测序数据的read_1 FASTQ2:样本测序数据的read_2 在“工作空间-表格”中添加sample的实体类型。下载“sample.csv”模板后，在本地使用Excel进行编辑，将每个样本实际...
示例：使用轻应用模板
重要 轻应用组装平台仅支持安装模板类型为轻应用的应用模板，其他类型不支持安装。模板文件成功上传后，系统会保留最近一次的模板信息。模板文件上传成功后，您可以看到类似以下界面。重要 一个项目中同时最多只能有一个模板处于安装过程中...
应用场景
基因测序 基因测序是一种新型基因检测技术，能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗，目前一个广为人知的用途是针对唐氏综合征的无创产前基因检测。随着基因...
开发前端界面
也支持多种流程节点，在对已有的服务能力做进一步编排和组装。在 服务方法 页面，单击 新建服务方法。在 新建服务方法 面板，完成相关配置。更多信息，请参见 可视化编排服务方法。单击 创建。服务方法保存成功后系统会自动打开服务方法...
常见问题
由于基因测序数据下机存在批次性，因此在投递分析时也存在明显的批次性，但同步提交大量任务时由于资源需求急速增加将导致任务并发调度性能降低，因此强烈建议客户在上传数据的同时分批提交分析任务，避免大量数据全部上传完成之后再统一...
示例：基于共享能力搭建轻应用
步骤一：创建轻应用 登录BizWorks，在 选择平台 下拉列表中选中 轻应用组装平台。单击页面右上角 图标或其文本框区域，在下拉列表中单击 BizWorks示例项目，单击 应用 页签。在 应用列表 页面，单击 新增应用。在 创建轻应用 面板，完成...
实验：构建应用首页和自定义页面
操作步骤 登录BizWorks，在 选择平台 下拉列表中选中 轻应用组装平台。单击页面右上角 图标或其文本框区域，在下拉列表中单击目标项目名称后，单击 应用 页签。在应用列表页面单击目标轻应用名称。在目标轻应用导航栏中，选择 服务管理>...
创建和管理项目环境
新增项目环境 登录BizWorks，在 选择平台 下拉列表中选中目标平台：微服务开发平台 或 轻应用组装平台。单击页面右上角的 图标或其文本框区域，在下拉列表中单击目标项目名称后，在平台顶部导航栏单击 运维 页签。在 项目环境管理 页面，...
解密ADB高效基因检测系统
通过高通量基因测序仪（High-throughput Sequencing），对核酸序列进行测序。为保证高通量测序仪的精度，可以将较长的核苷酸序列切成小的分片，分别进行测序。在读取基因序列时，基因序列的数据大小一般为50PB~200PB。通过高通量测序之后，...
应用场景
BatchCompute 广泛应用于电影动画渲染、生物数据分析、多媒体转码、金融保险分析等领域。典型案例 电影动画渲染 阿里云渲染云解决方案基于 BatchCompute 搭建。...生物数据分析 生物基因企业利用 BatchCompute 完成大规模基因组测序分析。
开发和管理自定义页面
步骤七：上传zip包文件到自定义页面（新增自定义页面）登录BizWorks，在 选择平台 下拉列表中选中 轻应用组装平台。单击页面右上角 图标或其文本框区域，在下拉列表中单击目标项目名称后，单击 应用 页签。在应用列表页面单击目标轻应用...
实践教程概览
使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序 本教程介绍如何使用E-HPC集群运行BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序计算。在进行基因测序时，您可以使用BWA构建索引及比对记录，再使用Samtools对比对记录进行排序，然后使用GATK去除重复序列...
计费概述
平台收费明细如下：30x WGS测序样本，~90G fastq文件 使用 sentieon/danseq:201911-v1.1 基因分析应用，5小时完成费用总计 应用步骤 作业并行数 运行时长 收费项 规格 单价 小计 单步骤（计算作业）费用 单样本（运行任务）费用总计 ...
模型画布简介
模型中心提供在模型画布中对业务模型进行组装、编排。在模型画布中，您可通过鼠标的拖拽和简单的条件设定，即可快速实现数据和原子算法的快速组装，即便是没有基础的业务人员，也可方便的建立自己的模型、形成自己的标签、自主探索使用数据...
基因计算工作流
场景描述 本文适合利用容器服务Kubernetes版上的工作流引擎进行大规模基因测序的场景。阿里云工作流引擎基于开源项目Argo实现，支持并发、循环、重试等多种执行策略典型的基因计算过程，把数据分批进行计算，按照规定好的步骤依次完成计算...
渲染卡片
第一步，组装卡片配置信息；第二步，根据配置信息请求卡片，获取卡片实例；第三步，通过卡片实例，使用卡片 View 去渲染；第四步，在整个业务完成后，在 destroy 声明周期中，释放卡片。具体流程如下：组装卡片配置信息。创建配置信息，并...
渲染卡片
渲染卡片的流程分为四部分，第一步，组装卡片配置信息；第二步，根据配置信息请求卡片，获取到卡片实例；第三步，通过卡片实例，使用卡片 View 去渲染；第四步，在整个业务完成后，在 destroy 声明周期中，释放卡片。具体流程如下：组装...
GetTemplate-查询应用模板详情
true Help string 帮助信息 测序reads文件 StepOrder long 步骤顺序 2 RequestId string 请求 ID DA980AD0-158F-44F3-847D-5EAB96C0EB6B Source string 应用来源 EasyGene Workspace string 工作空间名称 test-workspace RootEntity string...
应用场景
生命科学 生物信息学：使用E-HPC对大量生物基因组进行测序等处理，从而获取基因组信息和数据分析结果，来解决生物和医学领域的难题。动力学模拟：使用E-HPC进行大规模的分子动力模拟，来预测分析生物蛋白质分子、脂质分子间的相互作用和...
移动测试服务提供哪些测试项目？
移动测试服务目前提供以下测试项目：Android 应用测试：包括兼容性测试、功能测试、性能测试、远程真机租用、在线录制、...iOS 应用测试：包括兼容性测序、功能测试、性能测试、远程真机租用、在线录制。H5 测试、小程序测试 适用于 移动测试
功能发布记录
创建和管理中心应用 管理应用接口 生成代码 扫描上报和合并代码模型 轻应用组装平台 新工作台发布：功能菜单调整。平台入口调整：轻应用组装平台入口调整。轻应用菜单调整：应用菜单位置调整。支持REST API、MYSQL类型的数据源：支持依赖...
ack-workflow
组件介绍 ack-workflow基于原生Argo Workflow开发，支持您在集群中部署大型工作流，主要面向标准化的工作流场景，例如AI推理、自动驾驶仿真、基因测序任务等。安装ack-workflow 您可以通过容器服务ACK的组件管理页面安装ack-workflow，具体...
定义实体
实体是组装整个对话流的最最关键的原材料，建议放在第一步进行梳理和定义，这样可以在后期不论是在意图里需要用到，还是在触发节点里用到，都可以提高构建效率。理解 实体是组装整个对话流的最最关键的原材料，建议放在第一步进行梳理和...
基因数据文件
其他来源数据处理方式 阿里云其他用户账号数据 如果用户的基因数据来源与其他阿里云用户，如测序服务商。可由对方通过阿里云访问控制（RAM）授权你访问存储数据的bucket（见常见问题中“基因分析平台能否跨账号访问OSS资源”），然后基因...
应用场景
高性能计算 适用于大规模高性能科学计算、并行计算、仿真计算等场景，如气象预报、生物制药、基因测序、图像处理等。推荐使用 弹性高性能计算E-HPC，弹性高性能计算可以将计算能力积聚，用并行计算方式解决更大规模的科学、工程和商业问题...
产品优势
阿里云基因分析平台是由阿里云完全托管，专门服务于基因测序行业的公有云产品。与传统的HPC集相比，无需任何前期投入，完全享有云计算敏捷灵活、按需付费和超大规模的优势。并且产品围绕基因行业的数据和应用特点，开发了众多专业能力，...
闲鱼
在端上的生产力得到释放时，闲鱼发现端的开发人员有机会向下层走一点，使服务端面向简单的数据组装逻辑，由端的开发人员一人闭环完成，这套模式尤其适用于一些小业务的需求。传统巨型应用的Serverless化改造。Serverless与业务胶水层的特点...
闲鱼
在端上的生产力得到释放时，闲鱼发现端的开发人员有机会向下层走一点，使服务端面向简单的数据组装逻辑，由端的开发人员一人闭环完成，这套模式尤其适用于一些小业务的需求。传统巨型应用的Serverless化改造。Serverless与业务胶水层的特点...
UpdateTemplate-更新应用模板
任务名称 Task1 VariableName string 是 变量名 fastq1 VariableType string 是 变量类型 String VariableValue string 是 变量值 read_1.fastq.gz Required boolean 是 是否必填 True Help string 否 帮助信息 测序reads文件 StepOrder ...
功能简介
数据探索（Data Discovery）是一款面向业务人员的业务模型（智能数据与智能算子组装）编排、调试、运行及运营管理产品，旨在将“大数据”变成“人人都可用的大数据”。数据探索面向行业客户和业务人员，提供工具内容一体化的业务模型构建...
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