应用场景

BatchCompute 广泛应用于电影动画渲染、生物数据分析、多媒体转码、金融保险分析等领域。典型案例 电影动画渲染 阿里云渲染云解决方案基于 BatchCompute 搭建。...生物数据分析 生物基因企业利用 BatchCompute 完成大规模基因组测序分析。

高效基因序列检索助力快速分析肺炎病毒

AnalyticDB MySQL版 基因向量抽取算法套用词向量空间训练模型,对已有生物基因的k-mers进行训练,便可将一个k-mer(基因序列中的一个词)转换成1024维向量。类似于词向量模型,k-mer向量模型也拥有和词向量模型相似的数理计算性质。向量...

历史功能发布记录(2020年及之前)

全部 应用中心概述 2020年04月 功能名称 功能描述 发布地域 相关文档 ACK基因计算AGS商用化开放 基因计算服务是阿里云基于容器Kubernetes技术面向生物行业提供的基因大数据计算服务,具有高效、弹性、可靠的优点,相比传统的基因计算过程...

应用场景

生命科学 生物信息学:使用E-HPC对大量生物基因组进行测序等处理,从而获取基因组信息和数据分析结果,来解决生物和医学领域的难题。动力学模拟:使用E-HPC进行大规模的分子动力模拟,来预测分析生物蛋白质分子、脂质分子间的相互作用和...

什么是弹性高性能计算E-HPC

弹性高性能计算将计算能力积聚,用并行计算方式解决更大规模的科学、工程和商业问题,在科研机构、石油勘探、金融市场、气象预报、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。产品架构 弹性高性能计算的产品架构如下图所示。弹性...

应用场景

高性能计算 适用于大规模高性能科学计算、并行计算、仿真计算等场景,如气象预报、生物制药、基因测序、图像处理等。推荐使用 弹性高性能计算E-HPC,弹性高性能计算可以将计算能力积聚,用并行计算方式解决更大规模的科学、工程和商业问题...

什么是基因分析平台?

阿里云基因分析平台(Genomics Computing Platform)是用户友好的基因分析一站式平台,端到端地提供数据传输、存储管理、生物信息分析等核心能力。平台支持GA4GH社区开放标准,集成丰富的流程工具和公共数据集,帮助用户安全高效、敏捷弹性...

医疗检验:SAE携手谱尼测试稳步上云共同抗疫

同时也是北京市批准的生物医药类工程实验室、北京市科委认定的工程技术研究中心、北京市经信委认定的企业技术中心。从2020年04月15日起,谱尼测试集团旗下的全资子公司北京谱尼医学便承担了北京新冠病毒核酸检验工作,疫情就是命令,防控...

Databricks Runtime

用于基因组的Databricks Runtime(敬请期待)用于基因组的 Databricks Runtime 是Databricks Runtime的一种变体,已针对基因组和生物医学数据进行了优化。Databricks Light(敬请期待)Databricks Light 为不需要Databricks Runtime提供的...

Android SDK接入

2.2 接入流程 2.3 运行demo工程 解压Android Demo工程 需要将包名、应用ID(appId)、应用密钥(appKey)、修改为正确的值。修改FetchAccessTokenCallBackImpl.fetchAccessToken方法,完成获取应用授权token。2.4 搭建开发环境 应用必须运行在...

SDK端接入

步骤二:在工程中导入SDK 解压离线人脸识别SDK包,将以下Android依赖包引入到您的应用工程中:lib-verify-xxx-release.aar SecurityBodySDK-external-release.aar SecurityGuardSDK-external-release.aar 设定依赖包所在的路径:apply ...

Prompt模板介绍

同时也可 下载完整工程,设置AK/AKS后运行 预置模型内容介绍 预置场景 介绍 推荐场景 预置Prompt 生成效果文案 营销标题生成 快速生成各流量渠道的吸引眼球的标题文案 营销推广 你是一名专业的【小红书】爆款标题专家。请你以【杭州亚运会...

解密ADB高效基因检测系统

基因检测流程 通常在生物分析检测中进行一次病原体检测,大约生成5亿个75BP的基因片段。过滤掉属于人的基因组织序列之后,仍需要查询1亿左右的基因片段。一般可以使用nBlast[1]工具进行基因匹配,整个病原体检测过程大约需要2小时~3小时,...

基因实体表格

除使用阿里云对象存储OSS为基因数据文件提供安全、可靠、无限的存储空间外,基因分析平台设计了符合生物样本数据(如患者、样本、组织等)管理需要的实体概念。实体(Entity)通过csv表格的形式,来定义包含的数据属性,并支持不同实体之间...

基因分析应用

基因数据分析工作,需要用户使用不同的生物信息学工具软件,进行一系列复杂的计算过程,才能得到最终的分析结果。以遗传病的数据分析举例,需要进行数据质控、序列比对、变异检测和变异注释等多个步骤。图1:基因数据分析流程(来源/《中华...

基本概念

应用/App 基因分析应用,使用流程描述语言(如 Workflow Description Language,WDL)编写的标准的、参数化的生物信息分析流程,清晰定义了分析的输入输出、运行环境和软件依赖等,通常包含多个具有依赖关系的分析步骤。平台提供中心化的...

实体表达式

基因分析平台通过 基因实体表格 来管理基因数据文件,举例来说,某个生物样本(S001),其拥有多个属性值。FASTQ1单元格里的值,即为该样本存在对象存储OSS的原始序列文件。同时表格之间通过引用关系,来定义生物样本所从属的病人(NO...

阿里云携手深势科技,助力泓博医药加速药物研发

深势科技是“AI for Science”科学研究范式的引领者和践行者,致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题,为生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究,打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。过去,深势科技...

产品优势

阿里云基因分析平台是由阿里云完全托管,专门服务于基因测序行业的公有云产品。与传统的HPC集相比,无需任何前期投入,完全享有云计算敏捷灵活、按需付费和超大规模的优势。并且产品围绕基因行业的数据和应用特点,开发了众多专业能力,...

基因数据文件

本文介绍基因分析平台中基因数据文件的使用方法,包括上传、下载、删除等操作。基因分析平台并不直接提供基因数据的存储功能,而是依赖于阿里云 对象存储OSS 来帮助用户管理自己的基因数据文件。在开通基因分析平台时,由用户授权给基因...

入门概述

本文介绍开始使用基因分析平台前的准备工作,产品基本功能和使用流程,帮助您快速上手。准备工作 使用基因分析平台产品前,请确保您已经开通了阿里云账号并完成实名认证。相关操作参考如下:阿里云账号注册流程 个人实名认证 企业实名认证 ...

工作空间

本文介绍基因分析平台中工作空间的使用方法。基因分析平台中的所有操作,都必须在工作空间内进行。用户可以通过工作空间进行基因数据、分析应用和运行任务的管理,满足数据隔离、权限控制、费用统计等业务需求。创建工作空间 在工作空间...

AGS概览

阿里云基因计算AGS(Alibaba Cloud Genomics Service)是由阿里云推出极速、低成本、高精度的基因组测序二级分析的云服务,主要提供以容器平台为基础的生物信息工作流服务和无需搭建集群,开箱即用的加速API服务。本文介绍什么是AGS及其...

应用场景

基因分析平台广泛用于基因数据从样本到报告的分析过程。典型应用场景包括基因数据分析、测序生产自动化和基因云平台开发等。基因数据分析 为任意规模用户,提供开箱即用的基因分析服务,效率高,成本低,灵活可靠,最快30分钟即可获取海量...

常见问题

本文介绍基因分析平台的版本变更信息,包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。问:是否有用户需要的分析应用能够直接使用?答:基因分析平台通过应用仓库为用户提供开箱即用的公共应用,用户只需安装到工作空间即可使用。这部分...

欠费说明

本文介绍基因分析平台产生欠费之后的服务状态和处理策略。如果您账户的可用额度(含阿里云账户余额、代金券、优惠券等)小于待结算的账单,即被判定为账户欠费。警告 当平台欠费后会影响正在执行的运行任务,系统会提醒或通知您,请及时...

控制台快速开始

本文介绍如何通过产品控制台,在两分钟内快速完成一个基因分析任务,帮助用户熟悉基因平台基本操作。点击应用仓库中的 sentieon/dnaseq 公共应用。点击“安装运行”,选择已创建的工作空间,如默认创建的“default-workspace”,点击安装。...

产品动态

本文介绍基因分析平台的版本变更信息,包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。2021年5月 发布时间 版本变更内容 核心功能特性 2021-05-28 基因分析平台公测发布(北京、深圳地域首发)生信流程开发、版本化管理和计算分析,支持...

计费概述

本文介绍基因分析平台的计费模式、计费项、关联的其他云产品费用。概述 基因分析平台是阿里云托管的,完全Serverless化的基因计算服务。无需提前创建和管理任何集群,所有资源完全弹性按需,支持从0到千万的任意样本规模,且只需要为实际...

Sentieon

关于Sentioen ​Sentieon® 成立于2014年,拥有算法、软件和系统调优的专业团队,开发了众多高度优化生物信息分析应用,获得precisionFDA组织的挑战赛的冠军,并在大学、医院等知名机构中得到广泛应用。软件功能 基因分析平台集成了...

服务条款

阿里云基因分析平台(Genomics Computing Platform)的服务条款,请参见 阿里云产品服务协议。

GetPublicDataset-查询公共数据集详情

请求参数 名称 类型 必填 描述 示例值 DatasetName string 是 数据集名称 西蒙斯基因组多样性计划 Attributes array 否 指定需要查询的属性列表 string 否 查询属性 DatasetName,DatasetDescription,About,AccessRequirements,Copyright,...

产品公告

本文介绍基因分析平台产品通知公告和活动信息。优惠通知 基因分析平台目前正式公测上线,为所有新用户提供按量付费7折的优惠活动,生效时间 从2021年6月1日开始到2021年11月31日结束。优惠后的产品定价信息如下:计费项 说明 公测优惠期间...

使用限制

本文介绍基因分析平台功能相关的一些限制,以便您更好地使用。可用地域 基因分析平台支持的地域如下表所示,用户只能在可用地域内创建工作空间用于基因数据的管理和分析工作。地域 备注 华北2(北京)cn-beijing 华南1(深圳)cn-shenzhen ...

使用平台公共应用

本文介绍如何使用平台公共应用进行基因数据分析。基因分析平台的 应用仓库 提供了不同研究领域和分类的公共应用,这些都是权威的、经过验证的行业最佳实践,并且提供了常见的运行参数,真正的帮助用户实现开箱即用的基因数据分析。浏览公共...

设置运行时属性

本文介绍基因分析平台支持的运行时属性,并比较阿里云与其他计算后端的差别。基因分析平台目前使用WDL作为分析应用标准,用户可以通过每个Task中的runtime来定义计算作业所需要消耗的平台资源。平台支持的运行时属性 重要 基因分析平台运行...

运行选项

本文介绍基因分析平台支持的运行选项,以及对分析结果的影响。Call-Caching Call-Caching是指当用户在基因分析平台中计算作业,被检测到与之前的执行记录一致,可以直接使用之前的计算结果而无需重新计算,可以节省时间和费用。简单来说,...

ListPublicDataset-获取公共数据集列表

Tags array 公共数据集标签列表 string 标签 遗传多样性 DatasetName string 公共数据集名称 西蒙斯基因组多样性计划 DatasetDescription string 西蒙斯基因组多样性计划(Simons Genome Diversity Project,SGDP)是目前世界上最大、质量最高...

查看消费明细

本文介绍基因分析平台相关的费用账单和消费明细。操作步骤 登录阿里云 管理控制台。单击顶部导航栏的“费用”,进入用户中心。在左侧导航栏根据需要,单击不同的标签页,查看消费情况。说明 按量付费资源,从资源使用到计费出账有一定延迟...

创建运行任务

本文介绍如何在工作空间中,使用基因应用创建运行任务。步骤一:选择应用版本 在工作空间的应用配置中,浏览基因分析应用,点击“运行”。步骤二:设置运行选项 点击应用版本选择框,可选择应用相应版本或标签。Call-Caching:是否复用此前...
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