阿里云携手深势科技，助力泓博医药加速药物研发
泓博医药执行副总裁蔡振伟表示：“深势科技的Hermite®平台加上阿里云高性能计算E-HPC集群，大幅提升了泓博医药分子模拟效率，降低了泓博医药的合成成本，也减少了定制合成的等待时间，大大缩短管线推进到临床候选化合物的时间。...
【20230401】负载均衡LCU取消向上取整计费逻辑
调整前后账单变化示例 本示例以NLB产品为例模拟LCU计费逻辑调整前后的变化，仅供参考，具体费用请以实际账单为准。分类 调整前 调整后 LCU计算公式 每小时LCU费=LCU单价(元/个)×每小时LCU个数 每小时LCU个数 实际消耗：0.1 账单显示消耗：...
应用场景
动力学模拟：使用E-HPC进行大规模的分子动力模拟，来预测分析生物蛋白质分子、脂质分子间的相互作用和变化。新药研发：E-HPC帮助研发人员实现大量小分子库的快速并发处理。科研教育 E-HPC可以给政府、高校和超算中心提供超算服务，用于研究...
软件概述
Intel-MPI 2018 Intel-MKL 2018 Intel-ICC-RUNTIME 2018 GROMACS-GPU 2018.1 分子动力学模拟软件，多节点GPU加速版本。OpenMPI 3.0.0 CUDA-Toolkit 9.0 HELYX-OS 2.4.0 流体力学前处理软件，支持可视化版本。无 HMMER 3.2.1 基于隐马尔可夫...
AutoDock Vina Ehpc服务实例部署文档
AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务（ComputeNest）的用户侧权限 计费说明 AutoDock Vina社区版在计算巢部署的费用主要涉及：弹性高性能计算集群（EHPC）费用 文件系统（NAS）费用 流量带宽费用 部署架构 服务实例由一个EHPC...
AutoDock Vina Ehpc计算巢部署文档
AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务（ComputeNest）的用户侧权限 计费说明 AutoDock Vina社区版在计算巢部署的费用主要涉及：弹性高性能计算集群（EHPC）费用 文件系统（NAS）费用 流量带宽费用 部署架构 部署由一个ehpc集群...
使用AutoDock Vina软件进行药物筛选
本文通过模拟小分子配体和生物大分子受体相互作用的过程，预测配体与受体的结合模式和亲和力，模拟实现对药物的筛选。目前商业应用较广泛的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库，均可提供大量配体模拟计算配体和给定受体的相互作用。由于不同...
通过客户端提交作业
视频教程 相关文档 配置客户端所需环境 登录E-HPC客户端 运行GROMACS进行分子动力学模拟
名词解释
营销作弊 平台推广活动时，欺诈分子会通过模拟器、虚假手机号码、人工打码等方式绕过平台验证，批量套取优惠，给平台造成不必要的资金损失。盗卡支付 登录网络的欺诈分子通过木马钓鱼等方式获得用户支付账号信息并进行支付行为，导致用户...
使用GROMACS进行分子动力学模拟
本文以GROMACS软件为例介绍如何在E-HPC上进行分子动力学模拟。背景信息 GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，用于对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子动力学模拟。GROMACS主要用于生物...
运行GROMACS进行分子动力学模拟
E-HPC客户端提供了可视化的页面来配置GROMACS，可以快速提交GROMACS作业进行分子动力学模拟。背景信息 GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，可以对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子...
实践教程概览
业务应用 实践教程 主要内容 使用LAMMPS软件进行工业仿真 LAMMPS是一款经典分子动力学软件，其包含的势函数可用于固体材料（金属、半导体）、软物质（生物大分子，聚合物）、粗粒化或介观尺度模型体系。本教程介绍如何使用E-HPC集群运行...
Gromacs Ehpc计算巢快速部署文档
GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，用于对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子动力学模拟。GROMACS主要用于生物化学分子，如蛋白质、脂质等具有多种复杂键合相互作用的核酸分析。...
创建作业
本文以运行水分子算例介绍如何快速创建作业。前提条件 已在集群中创建用户，具体操作，请参见 创建用户。操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在 集群 页面，找到gromacs-test集群，单击 远程连接。在 ...
高性能计算优化型实例概述
高性能计算优化型实例规格族hpc8ae hpc8ae实例专为工业仿真、EDA（Electronic Design Automation）仿真、地质勘探、气象预报、分子动力学模拟等计算和网络密集的紧密耦合的HPC工作负载而设计。提供高达3.75 GHz的最新的第四代EPYC™（Genoa...
成本数据模型介绍
集群间接成本 管理ACK集群所需的额外费用或间接开销，例如集群管理费用。集群分配成本 集群中已分配的空间按比例分摊集群资产成本时，分摊的成本数额。集群闲置成本 集群中未被分配的空间按比例分摊集群资产成本，分摊的成本数额。Pod分摊...
客户端功能概述
提交作业 运行应用 应用中心支持界面化提交作业，目前支持以下应用：GROMACS HPL iPerf FIO AutoDock Vina 运行GROMACS进行分子动力学模拟 运行HPL、iPerf和FIO以测试集群性能 使用AutoDock Vina软件进行药物筛选 查询作业 提交作业后，...
模拟访问测试（可选）
说明 模拟访问等同于正常的DCDN访问，因此也会产生DCDN基础服务和增值服务费用（如果测试的是增值服务），计费方式与正常使用DCDN的计费方式相同。详细信息，请参见 计费概述。前提条件 您已成功添加服务域名。如果未添加，请参见 添加服务...
API概览
RollbackStagingConfig 回滚模拟环境配置 调用RollbackStagingConfig可以起到回滚模拟环境配置的作用，配置回滚后的模拟环境将被还原为初始状态，模拟环境下的所有配置都将被清空。PublishStagingConfigToProduction 发布模拟环境配置到...
高级设置
重要 提升采样率时，会额外收取rate%的费用。例如采样率为20%会额外收取20%*VUM的费用。建连超时时间 压测请求访问压测API的可超时时间。输入框中只需填写500 ms的倍数，范围区间为(1,120]。例如若超时时间为5000 ms，则只需填写10。请求...
模拟访问测试（可选）
说明 模拟访问等同于正常的CDN访问，因此也会产生CDN基础服务和增值服务费用（如果测试的是增值服务），计费方式与正常使用CDN的计费方式相同。详细信息，请参见 计费组成。前提条件 您已成功添加加速域名。如果未添加，请参见 添加加速...
准备工作
在开始演示解决方案前，需要您在DMS...该操作会产生费用，您可通过按量付费或包年包月的计费方式购买该服务，费用信息请参见 产品定价说明。授予普通用户 poc_dev 库和 poc_prod 库的 查询 和 变更 权限。具体操作，请参见 管理访问控制权限。
使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS
在模拟原子、分子计算中并行效率高，广泛应用于材料、物理、化学等模拟场景。使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS，可以加快构建应用程序，提升应用性能。准备工作 创建E-HPC集群。具体操作，请参见 使用向导创建集群。配置集群时，本文使用的...
按量计费
按量计费是一种先使用后付费的计费方式，根据资源的实际使用量收费。当您开通网络分析与监控的按量计费后，根据运营商探测点的实际使用量收费。站点监控（定时拨测）站点监控按量计费的计费规则如下表所示。计费规则 说明 适用场景 站点...
控制台使用问题
如何使用物联网平台设备模拟器进行设备接入和远程控制 模拟设备接入物联网平台进行上下行通信的具体操作，请参见 设备模拟器。设备在线后，可使用在线调试的远程登录功能，通过SSH协议的网络服务远程访问设备，在设备的远程控制台输入设备...
常见问题概述
计费相关 如何选购PTS资源包？若同时购买了资源包和包年包月，如何抵扣？使用ECS公网IP压测会产生流量费用吗？使用SLB公网IP压测会产生流量费用吗？并发和RPS相关 RPS模式下，为何当前统计的TPS比设置的RPS要多？RPS模式的并发量是如何计算...
算力计费
阿里云边缘计算服务ENS的边缘算力计费方式默认为后付费方式。通过本文，您可以了解阿里云ENS边缘算力的计费详情。后付费 支持按月或按日计费模式。说明 若您想切换计费方式，请联系商务经理进行咨询。边缘算力计费由边缘虚核、边缘内存和...
通过CADT实现NLB可用区级容灾演练
计费说明 云速搭CADT容灾管理服务 按1年中购买的实例数量计费。具体计费规则，请参见 CADT容灾管理服务计费说明。应用示例 作为演示，本文部署了如下图所示的CADT应用，用于模拟NLB可用区级容灾场景，验证NLB高可用。本文以模拟NLB实例的 ...
通过CADT实现ALB可用区级容灾演练
计费说明 云速搭CADT容灾管理服务 按1年中购买的实例数量计费。具体计费规则，请参见 CADT容灾管理服务计费说明。应用示例 作为演示，本文部署了如下图所示的CADT应用，用于模拟ALB可用区级容灾场景，验证ALB高可用。以下图应用为例，本文...
使用成本优化功能实现降本增效
注意事项 本文所涉及的价格数据均为示例值，实际价格以产品购买页面为准。以下典型案例的评估方式比较简单，在实际业务实施过程中，您需要综合多方面考虑，建议您依据实际情况逐渐变配至推荐方案，并关注变配后效果。典型场景一：包年包月...
什么是云拨测
云拨测（Synthetics Monitor）通过部署在全球各地的监测点，模拟真实用户从全球不同地区不同网络条件访问在线服务，持续对网络质量、网站性能、文件传输等场景进行可用性监测和性能监测。您可以通过可视化大盘查看监测数据，并对数据进行多...
概览
开通网络分析与监控不会产生任何费用，当您使用站点监控功能时，将按照实际使用量进行计费。关于站点监控的计费说明，请参见 站点监控（定时拨测）或 资源包。应用场景 站点监控主要用于通过发送模拟真实用户访问的探测请求，监控从阿里云...
使用Topic通信
消息服务MNS的计费，请参见 价格说明。服务器向设备下发数据 设备接收消息，需要相应Topic的 订阅 权限。设备主动订阅Topic后，设备详情页的 Topic列表 页签才会出现相应Topic。订阅方式如下：使用MQTT.fx接入物联网平台：设备在线后使用 ...
Web应用托管服务的审计事件
DescribeEcsScalingPrice 查询ECS伸缩价格。DescribeEnvResource 查询一个环境内的所有资源。DescribeEvents 查询事件。DescribeGatherLogResult 查询一个收集日志的变更信息。DescribeGatherStatsResult 查询一个收集诊断的变更信息。...
表格存储收费方式详解
表格存储支持后付费，根据一个账单周期内各个资源的实际使用量进行计量计费，无需额外购买实例费用。目前表格存储一共有4个维度的计量项。表格存储根据账单周期（小时）中的实际使用量来进行计量计费。数据存储量 预留读吞吐量和预留写吞吐...
测试环境
您可以在测试环境中模拟生产环境配置、调试开发中的代码和对历史版本代码进行重测，由于测试环境和生产环境（现行业务环境）隔离，因此您在测试环境中进行的任何操作，不必担心对现行业务的影响。当您在测试环境完成边缘函数所有测试后，...
ALB实例变配
加入共享带宽会产生相关费用，具体计费规则请参见 计费概述。当前 ALB 实例带宽峰值不满足您的业务需求时，可以在负载均衡控制台选择加入共享带宽。登录 应用型负载均衡ALB控制台。在顶部菜单栏，选择实例所属的地域。在 实例 页面，找到...
设置App防护
App防护专门针对原生App端，提供可信通信、防机器脚本滥刷等安全防护，可以有效识别代理、模拟器、非法签名的请求。本文介绍了在应用端集成App防护SDK后，如何在Web应用防火墙控制台设置App防护的防护路径和版本防护功能，以及如何开启App...
测试环境
您可以在测试环境中模拟生产环境配置、调试开发中的代码和对历史版本代码进行重测，由于测试环境和生产环境（现行业务环境）隔离，因此您在测试环境中进行的任何操作，不必担心对现行业务的影响。当您在测试环境完成边缘函数所有测试后，...
新手指引
初识阿里云CDN 什么是阿里云CDN 为什么需要CDN 阿里云CDN的优势 加速原理 使用限制 CDN基本概念 购买指南 阿里云CDN的计费分为，基础服务计费（必选）+增值服务计费（可选），您可根据业务需要选择最优的计费方案。详情请参见 计费概述。...
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