阿里云携手深势科技，助力泓博医药加速药物研发
泓博医药执行副总裁蔡振伟表示：“深势科技的Hermite®平台加上阿里云高性能计算E-HPC集群，大幅提升了泓博医药分子模拟效率，降低了泓博医药的合成成本，也减少了定制合成的等待时间，大大缩短管线推进到临床候选化合物的时间。...
应用场景
动力学模拟：使用E-HPC进行大规模的分子动力模拟，来预测分析生物蛋白质分子、脂质分子间的相互作用和变化。新药研发：E-HPC帮助研发人员实现大量小分子库的快速并发处理。科研教育 E-HPC可以给政府、高校和超算中心提供超算服务，用于研究...
AutoDock Vina Ehpc服务实例部署文档
步骤二：提交作业 本文通过模拟小分子配体和生物大分子受体相互作用的过程，预测配体与受体的结合模式和亲和力，模拟实现对药物的筛选。目前商业应用较广泛的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库，均可提供大量配体模拟计算配体和给定受体的...
AutoDock Vina Ehpc计算巢部署文档
步骤二：提交作业 本文通过模拟小分子配体和生物大分子受体相互作用的过程，预测配体与受体的结合模式和亲和力，模拟实现对药物的筛选。目前商业应用较广泛的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库，均可提供大量配体模拟计算配体和给定受体的...
使用AutoDock Vina软件进行药物筛选
本文通过模拟小分子配体和生物大分子受体相互作用的过程，预测配体与受体的结合模式和亲和力，模拟实现对药物的筛选。目前商业应用较广泛的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库，均可提供大量配体模拟计算配体和给定受体的相互作用。由于不同...
软件概述
Intel-MPI 2018 Intel-MKL 2018 Intel-ICC-RUNTIME 2018 GROMACS-GPU 2018.1 分子动力学模拟软件，多节点GPU加速版本。OpenMPI 3.0.0 CUDA-Toolkit 9.0 HELYX-OS 2.4.0 流体力学前处理软件，支持可视化版本。无 HMMER 3.2.1 基于隐马尔可夫...
通过客户端提交作业
视频教程 相关文档 配置客户端所需环境 登录E-HPC客户端 运行GROMACS进行分子动力学模拟
名词解释
营销作弊 平台推广活动时，欺诈分子会通过模拟器、虚假手机号码、人工打码等方式绕过平台验证，批量套取优惠，给平台造成不必要的资金损失。盗卡支付 登录网络的欺诈分子通过木马钓鱼等方式获得用户支付账号信息并进行支付行为，导致用户...
使用GROMACS进行分子动力学模拟
本文以GROMACS软件为例介绍如何在E-HPC上进行分子动力学模拟。背景信息 GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，用于对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子动力学模拟。GROMACS主要用于生物...
实践教程概览
使用GROMACS进行分子动力学模拟 GROMACS是一款通用软件，用于对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子动力学模拟，主要用于生物化学分子，如蛋白质、脂质等具有多种复杂键合相互作用的核酸分析。本教程以GROMACS软件为例介绍...
运行GROMACS进行分子动力学模拟
E-HPC客户端提供了可视化的页面来配置GROMACS，可以快速提交GROMACS作业进行分子动力学模拟。背景信息 GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，可以对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子...
高性能计算优化型实例概述
高性能计算优化型实例规格族hpc8ae hpc8ae实例专为工业仿真、EDA（Electronic Design Automation）仿真、地质勘探、气象预报、分子动力学模拟等计算和网络密集的紧密耦合的HPC工作负载而设计。提供高达3.75 GHz的最新的第四代EPYC™（Genoa...
客户端功能概述
提交作业 运行应用 应用中心支持界面化提交作业，目前支持以下应用：GROMACS HPL iPerf FIO AutoDock Vina 运行GROMACS进行分子动力学模拟 运行HPL、iPerf和FIO以测试集群性能 使用AutoDock Vina软件进行药物筛选 查询作业 提交作业后，...
Gromacs Ehpc计算巢快速部署文档
GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，用于对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子动力学模拟。GROMACS主要用于生物化学分子，如蛋白质、脂质等具有多种复杂键合相互作用的核酸分析。...
创建作业
说明 本算例为模拟大量水分子在给定空间、温度内的运动过程。cd/home/gmx.test;wget https://public-ehpc-package.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/water_GMX50_bare.tar.gz;tar xzvf water_GMX50_bare.tar.gz;chown-R gmx.test water-cut1.0...
使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS
在模拟原子、分子计算中并行效率高，广泛应用于材料、物理、化学等模拟场景。使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS，可以加快构建应用程序，提升应用性能。准备工作 创建E-HPC集群。具体操作，请参见 使用向导创建集群。配置集群时，本文使用的...
用钉钉小程序控制HaaS100播放语音示例
本地的方式可以快速验证硬件和端测软件的基础功能是否OK，云端钉一体的方式让用户在任何一款手机、平板设备上都可以通过支付宝或者钉钉小程序远程控制HaaS100音乐播放器，更具有可玩性。祝您体验HaaS云端钉一体智能语音播放器方案愉快。
功能发布记录
本文介绍视频直播Live的产品功能和对应的文档动态。2024-02 功能名称 变更类型 功能描述 相关文档 实时监控 升级 新增推流过程质量监控接口，通过接口可以获取到主播到CDN节点的接收音视频帧率、音视频时间戳、接受头次数、音视频码率、...
Prompt最佳实践
现在，请详细解释一下量子物理这一理论是如何描述和理解原子、分子等微观粒子的运动状态以及相互作用，并给出一个或两个著名的量子力学现象作为例子来帮助他们深入理解这一概念。请解释一下人工智能是什么，以及它是如何工作的。一家科技...
查看作业结果
本文介绍作业运行完成后如何查看作业性能指标和作业运行结果。前提条件 已创建作业并且作业已运行完成，具体操作，请参见 创建作业。操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。...使用VMD软件加载分子结构文件和轨迹文件，查看模拟效果。
生成测试数据
背景信息 OceanBase 开发者中心（OceanBase Developer Center，ODC）提供模拟数据功能供用户在测试数据库性能或者验证功能等需要大量模拟数据的场景下，能够快速根据表中的字段类型生成数据。注意事项 单次模拟数据上限为 1 亿行。拥有检查...
通过控制台使用EdgeScript
回滚模拟环境规则 如果您需要清空模拟环境下的配置，把模拟环境还原为初始化状态，请单击 回滚模拟环境规则，在弹出的对话框中单击 确定，即可删除模拟环境下的所有配置，将模拟环境回滚到初始化状态。配置修改流程 如果您需要基于最新发布...
通过控制台使用EdgeScript
回滚模拟环境规则 如果您需要清空模拟环境下的配置，把模拟环境还原为初始化状态，请单击 回滚模拟环境规则，在弹出的对话框中单击 确定，即可删除模拟环境下的所有配置，将模拟环境回滚到初始化状态。配置修改流程 如果您需要基于最新发布...
通过控制台使用EdgeScript
回滚模拟环境规则 如果您需要清空模拟环境下的配置，把模拟环境还原为初始化状态，请单击 回滚模拟环境规则，在弹出的对话框中单击 确定，即可删除模拟环境下的所有配置，将模拟环境回滚到初始化状态。配置修改流程 如果您需要基于最新发布...
边缘模拟器环境搭建和使用介绍
边缘模拟器：模拟了物业一体机的功能。主要内容：边缘模拟器的环境搭建以及如何运行。使用对象：对接物业一体机的设备厂商。使用场景：物业一体机设备准入测试认证。运行环境：Docker 一、安装Docker环境 1、Linux系统，以ubuntu为例，可以...
设备模拟器
物联网平台提供的设备模拟器，可模拟真实设备与物联网平台建立连接。您可使用模拟数据，测试物联网平台与设备端之间的通信功能，并定位问题。本文介绍设备模拟接入物联网平台并进行通信的具体操作。功能说明 通过设备模拟器，可调试设备...
模拟上报设备数据
为了快速体验物联网数据服务的功能，获得数据服务所需要的数据，您可以使用设备模拟器，快速模拟生产车间的设备上报数据。本文介绍如何使用设备模拟器调试设备上报数据。前提条件 已创建产品和设备，具体操作，请参见 创建产品和设备。背景...
控制台配置边缘脚本
更新边缘脚本配置 单击 回滚模拟环境下的配置，即把模拟环境的配置还原到初始状态。单击 从生产环境复制规则，将发布到生产环境的规则同步到模拟环境。在模拟环境页面下，单击操作列下的 修改，更新边缘脚本规则。更新完成后，单击 打开...
基于Tair Vector实现分子结构近似检索
本文介绍基于Tair Vector实现化合物或药物分子结构近似检索的解决方案。背景信息 向量（Vector）检索在AI制药中扮演着至关重要的角色，在该方案中，通常以向量表示化合物和药物，并通过向量空间中的相似度计算来预测、优化它们之间的相互...
API 模拟
API 模拟是对某一 API 的返回值进行模拟（Mock），以提供特定的响应结果。要使用 API 模拟功能，需先前往 网关管理>功能开关 页面打开 API Mock 开关。操作步骤 完成以下操作步骤配置 API Mock：选择 API 管理 选项卡>API 列表操作列的 更...
测试工具
业务流程提交发布后可以在测试工具中进行测试，本文是介绍测试工具的简要...步骤2：模拟通话 在坐席通话内容和用户通话内容模拟中输入相应内容。根据业务场景对话内容模拟通话，测试流程是否完整。此时完成后，点击 结束本轮模拟 结束测试。
设备模拟器
考虑到用户没有大量可连接的实际设备来测试使用应用程序，物联网边缘计算同时提供一套设备模拟器（DeviceSimulator）的解决方案。设备模拟器包含两部分：驱动：在边缘端可以模拟所有类型的设备。设备的属性、事件、服务取决于物模型的定义...
使用数据实验室
日志服务数据实验室为您提供各种场景的模拟日志数据及各种公共数据集数据，便于您熟悉日志服务的查询分析、查看报表等各种操作。本文介绍如何使用阿里云数据实验室。前提条件 已开通日志服务。首次登录 日志服务控制台 时，根据页面提示...
CreateSimulatedSystemEvents-为实例预约模拟系统事件
调用CreateSimulatedSystemEvents为一台或多台ECS实例预约模拟系统事件。模拟系统事件相当于事件演习，不会真正执行事件，也不会对ECS实例产生影响。接口说明 预约模拟事件后，您可以通过 ECS 管理控制台、ECS API 和云监控服务查看已经...
应用场景
本文为您介绍向量检索服务在 电商智能搜索和偏好推荐、自然语言处理等AI问答系统、图库类网站多模态搜索、视频检索、分子检测与筛选等场景下的应用。电商智能搜索和偏好推荐场景 在电商智能搜索和偏好推荐场景中，向量数据库可以实现基于...
线上部署验证
本文介绍如何在ADP云端交付管控平台进行产品验证环境部署、资源规划以及模拟部署。1.验证环境在线部署（1）进入产品的部署验证页面，选择关联在线验证环境。在此步骤之前，您可以先行创建验证环境，详细操作可参考文档 验证环境创建。验证...
数据模拟器
日志服务推出数据模拟器，用于模拟接入各类数据。
（模拟）键盘输入文本
1.组件介绍 说明 必要前置组件：无 利用本组件可以模拟键盘输入文本内容。2.输入项 说明 请参照可视化编辑器内组件面板中各输入项的帮助信息 3.输出项 说明 请参照可视化编辑器内组件面板中各输出项的帮助信息 4.组件使用示例 4.1.组件配置...
步骤三：调试
在正式发布服务之前，可使用设备模拟器对业务服务进行调试。前提条件 已完成业务逻辑配置、部署和启动。具体操作，请参见 步骤二：配置空气净化和告警服务。背景信息 HTTP接口的服务调试，只需单击 调试 即可。日志中将显示调试结果。定时...
HTTPS设置
如果您选择重置，在串联链路每一次循环执行时，会重新初始化SSL状态，即每次串联链路的执行都会重新完成SSL上下文配置，这样可以更准确模拟每次循环代表不同用户的压测场景，但同时需要您注意开启循环重置SSL状态后会导致施压机额外的性能...
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