登录集群

规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH(22)1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到要登录的集群,单击 远程连接。...

使用LAMMPS软件进行工业仿真

vim lammps.pbs 作业脚本内容示例如下:说明 以下示例使用1个计算节点的32 vCPU,使用32个MPI任务进行高性能计算。请根据实际计算节点规格配置vCPU数,算力要求vCPU≥32。bin/sh#PBS-l select=1:ncpus=32:mpiprocs=32#PBS-j oe export ...

使用IMB软件和MPI通信库测试集群通信性能

MPI_DEBUG 5-np 2-ppn 1-host compute000,compute001/opt/intel-mpi-benchmarks/2019/IMB-MPI1 pingpong>IMB-pingpong#请根据实际调整参数 脚本示例使用2个计算节点,每个节点为8 vCPU,使用一个MPI任务进行高性能计算。实际测试中请根据...

使用AutoDock Vina软件进行药物筛选

本文以AutoDock Vina软件为例,介绍如何在E-HPC上进行高性能计算实现虚拟药物筛选。背景信息 分子对接(Molecular docking)是虚拟药物筛选中的关键环节。AutoDock Vina作为一款开源的分子对接软件,具有速度快、算法准确等优点,特别适用...

创建作业

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在 集群 页面,找到gromacs-test集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入gmx.test的用户名、密码和节点端口,单击 ssh连接。下载并解压算例。说明 本算例为模拟...

计算资源优化

产品序列包含通用计算、异构计算、高性能计算三大类,支持包括各类垂直场景增强型实例,比如网络增强型、存储增强型、内存增强型、安全增强型、大数据型、高主频型、异构计算实例等,提供高性价比产品。对于特定的高性能场景,用户可以根据...

通过控制台提交作业

作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等,具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能,本文介绍如何使用E-HPC...

管理共享存储

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理>共享存储。在页面上方选择目标集群,然后单击 资源管理 页签。在 资源管理 页签下,单击 挂载存储资源。在弹出面板,完成参数配置,然后单击 ...

集群概述

集群指运行高性能计算的节点集合,可以提供单节点不能提供的强大计算能力,拥有高性能、弹性扩展、稳定可靠等优点。本文介绍集群涉及的基本概念和功能。节点 E-HPC集群中的每个节点是一台ECS实例。按节点功能分类,可以分为登录节点、管控...

授权信息

本文为您介绍 弹性高性能计算(Ehpc)为RAM权限策略定义的操作(Action)、资源(Resource)和条件(Condition)。弹性高性能计算(Ehpc)的RAM代码(RamCode)为 ehpc,支持的授权粒度为 OPERATION。权限策略通用结构 权限策略支持JSON...

创建Serverless集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 集群。在 集群 页面右上角,将鼠标悬浮在 创建集群 右侧的 图标,单击 模板化创建。在 基本配置 区域,输入集群名称和登录密码。在模板区域上方,单击,...

使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:运行算例 ...

提交作业

作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前,您需要准备好作业文件,并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件:通过...

设置调度器参数

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理>调度器。在 集群 列表选择目标集群,在 调度器 列表选择调度器。设置调度器配置信息,然后在页面右上角,单击 提交。Slurm 如果是Slurm调度器,...

E-HPC普通服务角色

通过AliyunECSInstanceForEHPCRole,ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色,必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一:授予...

使用Environment Modules管理软件包

module load:加载模块 module unload:卸载模块 module list:显示已经加载的模块 操作步骤 以下通过Environment Modules软件卸载openmpi/3.0.0,然后加载openmpi/3.0.1版本示例来介绍如何设置modulefile:登录 弹性高性能计算控制台。...

使用Schrodinger软件计算分子结构

在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作,请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中,选择 Application>System Tools>Terminal。运行/opt/vmd/1.9....

通过命令行提交作业

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。提交作业 请根据集群...

创建以CPFS为共享存储的E-HPC集群

本文介绍如何创建以CPFS为共享存储的高性能计算集群,为您提供一个高IOPS、高吞吐、低时延的计算集群。背景信息 CPFS(Cloud Paralleled File System)是一种高性能并行文件存储系统,专为AI训练和E-HPC等高性能计算场景打造,最大支持数十...

使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序

高性能计算可以提供强大的算力支持,使用多种调度器提高并发效率,使用GPU进行计算加速等。本文以经典及普及的二代全基因组测序WGS(Whole Genome Sequencing)流程为例,结合二代测序软件GATK,介绍人类全基因组测序的通用流程。在实际...

应用场景

gn6i实例可以结合云桌面产品提供云端图形工作站服务,应用于影视动画设计、工业设计、医疗成像、高性能计算的结果呈现等场景。神行工具包(DeepGPU)应用场景 神行工具包中的组件主要包括神龙AI加速引擎AIACC(AIACC-Training和AIACC-...

使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:编译LAMMPS ...

常见问题

弹性高性能计算服务关联角色(AliyunServiceRoleForEHPC)是访问控制提供的一种服务关联角色,用于授权E-HPC访问关联云资源。通过AliyunServiceRoleForEHPC,E-HPC可以获得云服务器ECS、专有网络VPC、文件存储NAS等阿里云产品的访问权限。...

配置自动伸缩

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 弹性>自动伸缩。在 自动伸缩 页面,从集群列表中选择需要配置自动伸缩的集群。在 全局配置 区域完成参数配置。配置项 描述 开关设置 为集群内所有队列开启...

弹性网卡概述

您可以使用eRDMA弹性网卡将线下的RDMA应用平滑迁移到云上,获取成本更低、弹性更好的高性能RDMA服务,例如高性能计算、AI训练、大数据处理等。更多信息,请参见 eRDMA概述。弹性网卡数量较多时,您可以通过标签服务来分组管理。更多信息,...

7.0经济版

不同实例系列和节点规格的计算资源价格如下:包年包月 实例系列 节点规格 单价(元/节点/高性能(基础版)2C8G 283.631 高性能(基础版)4C16G 539.455 高性能(基础版)8C32G 1051.104 高性能(基础版)16C64G 2074.400 高可用版 2C16...

已停售的实例规格

处理器:3.2 GHz主频的Intel Xeon E5-2667 v4(Broadwell)处理器 计算性能稳定 I/O优化实例 仅支持SSD云盘和高效云盘 实例网络性能与计算规格对应(规格越高网络性能越强)适用场景:高性能Web前端服务器 高性能科学和工程应用 MMO游戏、...

什么是PolarDB MySQL标准版

采用最新一代阿里云高性能计算和存储基础设施,客户使用成本大幅下降。云原生的计算和存储分离架构,一写多读,灵活弹性,配置升降级和增加节点分钟级生效。多个计算节点共享存储,新增只读节点时只需支付计算节点费用,大大降低了扩容成本...

高性能参数模板

本章节详细介绍 PolarDB MySQL版 支持的高性能参数模板中的参数设置情况,以及如何开启高性能参数模板和开启高性能模板前后的性能提升情况。高性能参数模板简介 由于PolarDB的参数比较多,针对特定场景进行参数适配的学习成本比较高。为了...

功能特性

灵骏满足AI、HPC等计算密集场景需要的高性能算力,可实现高性能、大规模的池化算力,满足自动驾驶、科研、金融、生物制药等多行业的异构算力需求。本文为您介绍灵骏的功能特性。高速RDMA网络架构 阿里巴巴2016年开始投入专项研究RDMA...

概述

PolarDB MySQL版 推出了全局一致性(高性能模式)服务。PolarTrans事务系统利用提交时间戳技术CTS和RDMA网络,在内核层面提供全局一致性(高性能模式)服务,保证发往集群任意副本的读请求都可以获得强一致性的结果。本文档介绍了全局一致...

搭建高性能网络ACK集群

本文介绍搭建高性能网络ACK集群的场景描述、解决问题、架构图及操作参考链接。场景描述 容器的网络协议栈实现方式,导致容器之间的网络性能,相比服务器之间直接通信方式,会有一 定程度的下降。阿里云托管版容器服务ACK集群,支持自研的...

概述

本章节会全面描述基于云基础设施的高性能系统设计、实施和优化等环节,包括如下主要内容:高性能架构设计:包括高性能架构常见设计准则、业务适应规格和类型、可伸缩和可扩展、性能层面部分架构设计最佳实践和挑战和注意事项等内容。...

企业版和标准版功能对比

PolarDB MySQL版 企业版和标准版在功能上有很多差异,可分为集群管理、弹性管理、高性能、备份与恢复、高可用性、高安全、连接管理、高性价比、监控与优化、DB for AI、数据迁移&同步等11个类别。本文为您介绍这两个版本的功能区别,帮助您...

高性能检索版介绍

高性能检索版简介 OpenSearch-高性能检索版 是基于阿里巴巴自主研发的大规模分布式搜索引擎搭建的一站式智能搜索业务开发平台,在大数据场景下实现千亿数据毫秒级响应,提供订单、物流、保单等场景检索方案。OpenSearch-高性能检索版架构 ...

本地SSD型

本地SSD型实例规格族i3g i3g的特点如下:配备高性能(高IOPS、大吞吐、低访问延迟)NVMe SSD本地盘 计算:处理器与内存配比为1:4,为高性能数据库等场景设计 处理器:2.5 GHz主频的Intel ® Xeon ® Platinum 8269CY(Cascade Lake),睿频...

概述

高性能 性能提升,高性能版的全密态Spark计算引擎的性能是基础版的4倍,是开源社区Spark 3.2.0版本的1.9倍。加密方式灵活,支持加密数据文件中的单个数据列,从而减少了不必要的数据I/O开销。密钥介绍及处理机制 密钥介绍 用户主密钥(MEK...

购买按量付费集群

X86:X86架构搭载英特尔处理器,配套高性能网络,综合性能及稳定性全面提升,满足对业务稳定性及计算性能要求较高的企业级应用诉求。ARM:ARM架构底层采用阿里云自研倚天710处理器芯片及25 GE智能高速网卡,提供强劲的计算能力。配套高性能...

购买按量付费集群

X86:X86架构搭载英特尔处理器,配套高性能网络,综合性能及稳定性全面提升,满足对业务稳定性及计算性能要求较高的企业级应用诉求。ARM:ARM架构底层采用阿里云自研倚天710处理器芯片及25 GE智能高速网卡,提供强劲的计算能力。配套高性能...

ECU详解

弹性计算单元(Elastic compute units,简称ECU)是分析型数据库MySQL版中衡量实例计算能力的元单位。ECU由内存容量和磁盘容量组成。ECU分类 分析型数据库MySQL版中有高性能和大存储两种类型的ECU。高性能:以字母C或者H开头的ECU为高性能...
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