Nat. Biotechnol.| 基于生物活性建模识别抗SARS-CoV-2药物

Nat. Biotechnol.| 基于生物活性建模识别抗SARS-CoV-2药物

今天给大家介绍美国国立卫生研究院(NIH)和加拿大公共卫生局国家微生物实验室在Nature Biotechnology上联合发表的一篇文章“Biological activity-based modeling identifies antiviral leads against SARS-CoV-2...

Nat. Commun. | 多层生物分子网络的鲁棒性研究

Nat. Commun. | 多层生物分子网络的鲁棒性研究

今天给大家介绍华中科技大学人工智能与自动化学院Xueming Liu课题组、哈佛医学院Joseph Loscalzo团队和伦斯勒理工学院Jianxi Gao课题组合作发表在 Nature Communication上的一篇文章“Robustness and lethality in multilay...

Nat. Mach. Intell. | 生物医学关系抽取的机器学习新框架

Nat. Mach. Intell. | 生物医学关系抽取的机器学习新框架

今天给大家介绍的是清华大学曾坚阳教授课题组在Nature Machine Intelligence杂志上发表的一篇关于生物医学关系抽取的文章。在文中,作者提出了一种从大规模文献库中自动提取生物医学关系的机器学习框架—BERE。BERE使用混合编码网络从语义和句法两个方面更好地表示每个句子,并在考虑所...

Nat. Methods | 基于机器学习和生物物理的蛋白质-肽相互作用预测

Nat. Methods | 基于机器学习和生物物理的蛋白质-肽相互作用预测

2020年1月6日哈佛医学院Mohammed AlQuraishi和Peter K. Sorger研究团队合作在Nature methods上发表题Biophysical prediction of protein–peptide interactions and signaling network...

Nat. Biotechnol | PHATE:高维生物数据的可视化方法

Nat. Biotechnol | PHATE:高维生物数据的可视化方法

高维生物数据的可视化能帮助研究者以直观的方式了解数据。今天介绍2019年12月发表在Nature Biotechnology的可视化工作。1研究背景高维数据需要可视化工具,以直观的方式显示数据结构和模式。目前的降维可视化技术存在一些问题,如对噪声敏感、不能同时捕获数据的局部和全局非线性结构、受内存和...

Nat. Methods | ilastik:为生物图像分析而生的交互式机器学习平台

Nat. Methods | ilastik:为生物图像分析而生的交互式机器学习平台

工具简介来自德国海德堡大学的Hamprecht团队开发了一款使用简便的开源交互式工具—ilastik。ilastik能够给用户提供良好的基于机器学习的生物信息图像分析服务,这对于在计算机专业知识方面有所欠缺而又想使用机器学习来做图像分析的用户来说是一个福音。(文末附ilastik下载链接)研究背景随...

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