linux|shell编程|shell脚本的一些高级技巧(shell脚本内的括号,中括号,花括号,逻辑判断,脚本优雅退出等等)
前言:shell脚本说容易其实也是容易的,说难,那真的是可以难到让人挠头的地步,因为逻辑判断,自定义变量,环境变量,系统内置函数,脚本结构设计这些糅合到一起后,脚本可能会变的非常复杂了。那么,本文主要就shell脚本内使用系统函数(dirname,basename,exit),逻辑判断符号,gt,l...
shell高级技巧:提取vcf文件中一个contig
这是一个很小众的需求。大部分变异检测都是基于组装质量比较高的基因组,而不是那种初步拼接的contig。 由于初步拼接的参考序列通常会有成千上万个contig序列,也就导致在VCF的头文件的##contig=<ID=xxx,length=xxx>部分会有成千上万个contig,将这个文件加...
Linux Shell高级技巧(目录)
为了方便我们每个人的学习,这里将给出Linux Shell高级技巧五篇系列博客的目录以供大家在需要时参阅和查找。 Linux Shell高级技巧(一) http://www.cnblogs.com/stephen-liu74/archive/2011/12/22/2271167.html ...
sed命令详解 vim高级技巧 shell编程上
第1章 sed命令详解 1.1 查找固定的某一行 1.1.1 awk命令方法 [root@znix ~]# awk '!/oldboy/' person.txt 102,zhangyao,CTO 103,Alex,COO 104,yy,CFO 105,feixue,CIO 1.1.2 grep方法 ...
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