运行HPL、iPerf和FIO以测试集群性能
背景信息 测试集群benchmark性能主要使用以下几个软件：HPL：一个测试高性能计算集群系统浮点性能的基准程序。HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高性能计算集群的浮点计算能力。iPerf：一个...
实践教程概览
集群性能测试 实践教程 主要内容 使用HPL测试E-HPC浮点性能 HPL（The High-Performance Linpack Benchmark）是测试高性能计算集群系统浮点性能的基准。HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高...
使用HPL测试集群浮点性能
背景信息 HPL（The High-Performance Linpack Benchmark）是测试高性能计算集群系统浮点性能的基准。HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高性能计算集群的浮点计算能力。浮点计算峰值是指...
使用限制
本文介绍在使用弹性高性能计算时账号和功能相关的限制，以及提升配额的方式。...提交工单。产品功能 单个地域下，弹性高性能计算...单个文件系统可以挂载计算节点的数量 1000 无 单个文件系统容量上限 性能型NAS：1 PiB 极速型NAS：256 TiB 无
基本概念
本文汇总使用弹性高性能计算E-HPC过程中涉及的基本概念，方便您查询和了解相关概念。使用弹性高性能计算涉及的相关概念如下表所示。概念 说明 集群 集群指运行高性能计算的节点集合，可以提供单节点不能提供的强大计算能力，拥有高性能、...
监控存储资源
性能监控 查看存储性能如下指标信息：IOPS 吞吐量 延迟 元数据QPS 容量监控 查看存储容量如下指标信息：存储空间（不包括回收站）文件数 时间范围 支持快速选择常用时间范围，也可以自定义设置要查询的时间范围。快速选择：1小时、4小时、...
使用高性能容器应用
通过高性能容器应用，您可以在E-HPC集群上通过高性能容器应用启动高性能计算作业，从而降低业务部署的复杂性。高性能容器应用在支持E-HPC全部原有能力（如弹性伸缩、性能监控等）的基础上，可为您提供更加高效和便捷的计算解决方案。本文...
表设计规范
降低计算成本 规范化的表设计可以帮助您优化数据的读取，从而减少计算过程中的冗余读写和计算，提升计算性能，降低计算成本。降低维护成本 规范化的表分层设计能够直接体现业务的特点。例如，在规范化设计表的同时对数据通道中的数据采集...
使用GROMACS进行分子动力学模拟
步骤四：查看作业计算性能 说明 仅控制台支持查看作业计算性能，客户端暂不支持该功能。登录 弹性高性能计算控制台。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>E-HPC优化器。找到目标集群，单击 节点。在 节点性能 页签下，查看节点性能。选择...
计算资源优化
运行时的系统性能：优化调度、内存以及IO等子系统，在部分的开源基准测试中，相比其他操作系统约提升10%~30%性能。针对特定业务场景性能优化的 ECS 实例规格族选项 基于不同场景的需求，云服务器 ECS（Elastic Compute Service）为用户提供...
高性能计算优化型实例概述
高性能计算优化型实例规格族hpc8ae 高性能计算优化型实例规格族hpc7ip 高性能计算优化型实例规格族hpc6id 高性能计算优化型实例介绍 高性能计算优化型实例（以下简称HPC优化实例）是专为提升HPC工作负载性能，同时优化大规模运行成本而打造...
管理共享存储
如果您有更多的存储需求，可以为集群挂载新的存储资源，来缓解单个文件系统在性能、容量等方面的压力，支持更大规模集群的计算任务。本文介绍在创建E-HPC集群后，如何为集群挂载新的存储资源，以及如何卸载存储资源。前提条件 已创建存储...
自动伸缩最佳实践
本文以使用LAMMPS软件进行高性能计算介绍如何配置自动伸缩策略。背景信息 当您需要每天不定时提交作业，使用E-HPC集群几个小时进行大规模计算，然后释放节点，您可以针对不同的作业类型，配置不同的伸缩策略。配置伸缩策略后，系统可以根据...
高主频型
实例网络性能与计算规格对应（规格越高网络性能越强）适用场景：高网络包收发场景，例如视频弹幕、电信业务转发等 各种类型和规模的企业级应用 游戏服务器 中小型数据库系统、缓存、搜索集群 高性能科学计算 视频编码应用 hfg7包括的实例...
扩容混合云集群
混合云集群支持扩容，当业务发展导致集群计算节点不足时，您可以根据实际需求扩容集群，增加计算节点。前提条件 扩容节点所在地域有可用交换机，关于如何创建交换机，请参见 创建交换机。扩容节点所在地域有足够的ECS实例配额，具体操作，...
使用VNC远程可视化
弹性高性能计算提供VNC远程可视化功能，您可以通过控制台Web方式访问远程可视化图形界面。本文介绍如何连接可视化服务和停止可视化服务。前提条件 已安装VNC服务。开启方式如下：创建新的集群时，您可以在 软件配置 页开启VNC功能，系统将...
创建集群
交换机 vsw-uf643l4q2bk06wz*共享存储 文件系统ID 353cc4*（性能型NFS）默认选择第一个已创建的文件系统ID和挂载点，请确保该文件系统还有可用的挂载点余量。挂载点 353cc4*-ek*.cn-shanghai.nas.aliyuncs.com 单击 下一步，填写软件配置...
已停售的实例规格
存储增强型实例规格族g5se 通用型实例规格族sn2 RDMA增强型实例规格族c7re 计算型实例规格族sn1 高主频计算型实例规格族c4、ce4、cm4 FPGA计算型实例规格族F3 GPU虚拟化型实例规格族vgn6i GPU虚拟化型实例规格族vgn5i GPU计算型实例规格族...
创建混合云集群
您可以利用本地的HPC集群在阿里云扩容计算节点资源，统一调度云上资源和您的本地资源进行高性能计算。本文介绍如何通过E-HPC管理控制台创建混合云集群。前提条件 已创建专有网络VPC和交换机。具体操作，请参见 创建专有网络 和 创建交换机...
性能指标
性能指标 测试环境：1核16G内存，系统macOS 12.4，Java 8，传输带宽为100Mbps CPU：Intel(R)Core(TM)i7-9750H CPU@2.60GHz 客户端PIR数据在服务端数据库中 每批PIR元素个数 查询批数 密码算法 客户端PIR计算平均耗时(ms)服务端PIR计算平均...
已停售的GPU实例规格
GPU虚拟化型实例规格族vgn6i GPU虚拟化型实例规格族vgn5i GPU计算型超级计算集群实例规格族sccgn6e GPU计算型超级计算集群实例规格族sccgn6 GPU计算型实例规格族gn5 GPU可视化计算型实例规格族ga1 GPU虚拟化型实例规格族vgn6i vgn6i的特点...
超级计算集群概述
通用型超级计算集群实例规格族sccg7 计算型超级计算集群实例规格族sccc7 高主频计算型超级计算集群实例规格族scchfc6 高主频通用型超级计算集群实例规格族scchfg6 高主频内存型超级计算集群实例规格族scchfr6 高主频型超级计算集群实例规格...
评估合适的云服务
在进行高性能架构设计时，首先需要关注的是计算、存储、网络等基础云服务的选择。充分了解自身业务特征及指标，熟悉架构主要组件所涉及云产品方案类型，有利于业务和工作负载在不同的产品方案中受益，并使系统架构得以持续优化。数据库的...
集群概述
集群指运行高性能计算的节点集合，可以提供单节点不能提供的强大计算能力，拥有高性能、弹性扩展、稳定可靠等优点。本文介绍集群涉及的基本概念和功能。节点 E-HPC集群中的每个节点是一台ECS实例。按节点功能分类，可以分为登录节点、管控...
修复集群
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，选择待修复集群，单击 更多>修复。在弹出的 集群修复 页面，重新指定待修复集群的 镜像类型、镜像、调度器 和 域账号服务。...
本地SSD型
网络：支持IPv6 实例网络性能与计算规格对应（规格越高网络性能越强）适用场景：OLTP、高性能关系型数据库 NoSQL数据库（例如Cassandra、MongoDB等）Elasticsearch等搜索场景 与操作系统的兼容性说明 更多信息，请参见 本地SSD型i4实例规格...
参考：渐进式计算
渐进式计算（Progressive Computing）是处于传统的流计算和批处理之间的一种计算方式，具有高资源利用率和低延迟的优势。本文为您介绍渐进式计算的基础配置、作业调优配置以及使用示例。背景信息 渐进式计算能够处理增量数据并维护中间结果...
弹性裸金属服务器概述
本地SSD型弹性裸金属服务器实例规格族ebmi2g GPU计算型：GPU计算型弹性裸金属服务器实例规格族ebmgn7ex GPU计算型弹性裸金属服务器实例规格族ebmgn7e GPU计算型弹性裸金属服务器实例规格族ebmgn7ix GPU计算型弹性裸金属服务器实例规格族...
手动扩容集群
E-HPC集群支持手动扩容，当业务发展导致集群计算节点的资源不足时，您可以根据实际需求扩容集群，添加计算节点。前提条件 扩容节点所在地域有可用交换机，关于如何创建交换机，请参见 创建交换机。扩容节点所在地域有足够的ECS实例配额，...
基本概念
ECS实例规格 定义了ECS实例在计算性能、存储性能、网络性能等方面的基本属性，但需要同时配合镜像、块存储、网络等配置才能确定一台ECS实例的具体服务形态。镜像 提供了运行实例所需的信息，包括操作系统、初始化应用数据等。公共镜像 阿里...
通过控制台提交作业
作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元，包括Shell脚本、可执行文件等，具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能，本文介绍如何使用E-HPC...
API概览
本产品（弹性高性能计算/2018-04-12）的OpenAPI采用 RPC 签名风格，签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK，开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求，...
提交作业
作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元，包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前，您需要准备好作业文件，并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件：通过...
Gromacs Ehpc计算巢快速部署文档
GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是一款通用软件，用于对具有数百万颗粒子的系统进行基于牛顿运动方程的分子动力学模拟。GROMACS主要用于生物化学分子，如蛋白质、脂质等具有多种复杂键合相互作用的核酸分析。...
大数据型
计算：处理器：2.7 GHz主频的 ® Xeon ® 可扩展处理器（Ice Lake），全核睿频3.5 GHz，计算性能稳定 存储：I/O优化实例 仅支持ESSD云盘和ESSD AutoPL云盘 网络：支持IPv6 实例网络性能与计算规格对应（规格越高网络性能越强）适用场景：...
登录集群
规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH（22）1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到要登录的集群，单击 远程连接。...
使用向导创建集群
建议您通过弹性高性能计算管理控制台操作。步骤一：配置硬件信息 创建集群时，您必须配置集群的硬件信息。硬件决定了集群的性能，包括集群所处地域、集群部署方式、不同类型节点数量、网络类型、共享存储等。您可以根据您的业务需求选择...
AutoDock Vina Ehpc计算巢部署文档
AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务（ComputeNest）的用户侧权限 计费说明 AutoDock Vina社区版在计算巢部署的费用主要涉及：弹性高性能计算集群（EHPC）费用 文件系统（NAS）费用 流量带宽费用 部署架构 部署由一个ehpc集群...
配置自动伸缩
自动伸缩可以根据您配置的伸缩策略动态分配计算节点，实现根据实时负载自动增加或减少计算节点，以提高集群可用性，降低使用成本。本文介绍如何配置自动伸缩。功能优势 根据实时负载，自动增加计算节点，提高集群的可用性。在保证集群可用...
MemVerge服务计算巢模式部署文档
权限策略名称 备注 AliyunNASFullAccess 管理文件存储服务（NAS）的权限 AliyunECSFullAccess 管理云服务器服务（ECS）的权限 AliyunVPCFullAccess 管理专有网络（VPC）的权限 AliyunEHPCFullAccess 管理弹性高性能计算（EHPC）的权限 授予...
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