基因分析应用

以遗传病的数据分析举例,需要进行数据质控、序列比对、变异检测和变异注释等多个步骤。图1:基因数据分析流程(来源/《中华医学遗传学杂志》)我们以工作流(Pipeline or Workflow)来指代这些分析脚本。简单的来说,它可以是一段由用户...

软件概述

无 HMMER 3.2.1 基于隐马尔可夫模型,用于生物序列比对分析的软件。无 LAMMPS-CPU-INTELMPI 12Dec18 分子动力学模拟软件,多节点并行版本。Intel-MPI 2018 LAMMPS-GPU-OpenMPI 12Dec18 分子动力学模拟软件,多节点GPU加速版本。OpenMPI 3.0...

FAQ

序列和序列基数 为什么序列基数很重要?写入数据 如何写入整型的field value?TSDB For InfluxDB®如何处理重复数据点?HTTP API需要怎样的换行符?当将数据写入TSDB For InfluxDB®时,应该避免哪些文字和字符?当写入数据时,什么时候...

AGS概览

什么是AGS AGS主要应用于基因组测序二级分析,通过AGS加速API只需要15分钟即可完成一个30X WGS的基因比对、排序、去重、变异检测全流程,相比经典流程可加速120倍,比目前全球最快的FPGA/GPU方案仍能提速2~4倍。通过分析个体基因序列的突变...

内容检测API

内容安全的人脸比对,是否支持其他国家的人脸呢?内容安全视频流直播是如何计费的?内容安全直播流检测数据是如何回调的?为什么内容安全直播流检测已停止,但是还有数据在回调?在什么情况下内容安全直播流检测code会返回200?内容安全...

云安全中心反弹Shell多维检测技术详解

什么是反弹Shell 反弹Shell是黑客(即Shell攻击者)用于控制受害服务器的一种手段。Shell攻击者指定服务端,并将需要受害服务器执行的命令(标准输入、标准输出、标准错误等)重定向到该服务端。受害服务器主动连接攻击者的服务端程序,...

模式匹配

因此,要匹配在串内任何位置的序列,该模式必须以百分号开头和结尾。要匹配文本的下划线或者百分号,而不是匹配其它字符,在 pattern 里相应的字符必须前导逃逸字符。缺省的逃逸字符是反斜线,但是你可以用 ESCAPE 子句指定一个不同的逃逸...

时间序列数据库 TSDB

时间序列数据库产品系列是是广泛应用于物联网(IoT)设备监控系统,企业能源管理系统(EMS),生产安全监控系统,电力检测系统等行业场景的专业数据库产品,提供百万高效写入,高压缩比低成本存储、预降采样、插值、多维聚合计算,查询结果...

使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序

背景信息 生命科学领域内基因测序技术的飞速发展,人类发现的基因序列以指数级增长,对于如此数量庞大的基因进行同源性搜寻、比对、变异检查等,往往伴随着巨大的数据处理和并行计算。高性能计算可以提供强大的算力支持,使用多种调度器...

常见问题

金融级人脸比对方案 适合已经有留底用户两张以上人脸,单纯比对是否本人的低风险场景。通过接口传入两张图片,比对图片中两个人脸相似程度,确认是否同一个人。说明 该方案不验证身份信息真实性。信息核验 社交娱乐行业,在线游戏实名认证...

账单和用量查询

如果看到产品明细显示为 时间序列数据库TSDB 或时序数据库InfluxDB®版,说明费用是由 时间序列数据库TSDB 或时序数据库InfluxDB®版产品。为什么账单详情中Lindorm的费用比购买时显示的价格高?原因:账单详情中,产品 云原生多模数据库...

COPY

为了做到跨平台一致,COPY TO STDOUT 总是发送“”而不管服务器平台是什么。COPY FROM 能够处理以新行、回车或者回车/新行结尾的行。为了减少由作为数据的未加反斜线的新行或者回车带来的风险,如果输出中的行结束并不完全相似,COPY FROM ...

事务隔离

如果你能证明一个单一事务在独自运行时能做正确的事情,则你可以相信它在任何混合的可序列化事务中也能做正确的事情,即使它不知道那些其他事务做了些什么,否则它将不会成功提交。重要的是使用这种技术的环境有一种普遍的方法来处理序列化...

限制

如果订阅者被用作一个只读数据库,那么这通常不会是什么问题。不过,如果订阅者数据库预期有某种转换或者容错,那么序列需要被更新到最后的值,要么通过从发布者拷贝当前数据的防范(也许使用 pg_dump),要么从表本身决定一个足够高的值。...

实践教程概览

在进行基因测序时,您可以使用BWA构建索引及比对记录,再使用Samtools对比对记录进行排序,然后使用GATK去除重复序列、重新校正碱基质量值、变异检查。使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算 OpenFOAM是对连续介质力学问题进行数值计算的...

名词解释

标签(Tag):度量(Metric)虽然指明了要监测的指标项,但没有指明要针对什么对象的该指标项进行监测。标签(Tag)就是用于表明指标项监测针对的具体对象,属于指定度量下的数据子类别。一个标签(Tag)由一个标签键(TagKey)和一个对应...

合并

在TSDB For InfluxDB®中,查询自动将序列合并。示例 数据库 NOAA_water_database 中的measurement的 h2o_feet 是两个序列的一部分。第一个序列由measurement h2o_feet 和tag location=coyote_creek 组成。第二个序列由measurement h2o_...

产品概述

时间序列数据库(Time Series Database,简称 TSDB)是一种高性能、低成本、稳定可靠的在线时间序列数据库服务,提供高效读写、高压缩比存储、时序数据插值及聚合计算等服务,广泛应用于物联网(IoT)设备监控系统、企业能源管理系统(EMS)、...

LIMIT及SLIMIT子句

LIMIT 和 SLIMIT 分别限制每个查询返回的数据点个数和序列个数。LIMIT子句 LIMIT返回指定measurement中的前 N 个数据点。语法 SELECT_clause[INTO_clause]FROM_clause[WHERE_clause][GROUP_BY_clause][ORDER_BY_clause]LIMIT语法描述 N ...

产品优势

本文介绍时间序列数据库产品的优势。性能卓越 具有高效的读写能力,相较于开源的 OpenTSDB 和 InfluxDB,读写效率提升了数倍。支持横向扩展,性能可达到百万级别读和千万级别写入的数据点处理能力。存储成本低 基于高效压缩算法有效压缩...

基本概念解释

本文为用户介绍版权与专利...计算机程序是指能实现一定功能的代码化指令序列,或者符号化语句序列。文档指用来描述程序的内容、组成、设计、功能规格、开发情况、测试结果及使用方法的文字资料和图表,如程序设计说明书、流程图、用户手册等。

功能介绍

TSDB for Prometheus是阿里云时间序列数据库TSDB为Prometheus提供的一种高性能,低成本,稳定可靠的在线远端存储服务,提供高效读写,高压缩比存储。TSDB for Prometheus可无缝被Prometheus集成,在协议上原生支持Prometheus远端存储对接至...

TSDB开源生态概述

时间序列数据库TSDB以其强大的功能和兼容性,对于当前的一些开源解决方案实现了较好的适配。以下是TSDB与一些开源组件或开源项目对接的方法。Grafana如何对接TSDB Quick BI如何接入TSDB

OFFSET及SOFFSET子句

OFFSET 和 SOFFSET 分别标记数据点和序列返回的位置。OFFSET子句 OFFSET表示从查询结果中的第 N 个数据点开始返回。语法 SELECT_clause[INTO_clause]FROM_clause[WHERE_clause][GROUP_BY_clause][ORDER_BY_clause]LIMIT_clause OFFSET...

HTTP API 概览

几乎所有 TSDB 的特性都可以通过 API 来访问,比如查询时间序列数据、管理元数据和存储数据点。TSDB 的 HTTP API 本质上是 RESTful 的,同时也提供了替代访问策略,因为不是所有 client 都可以遵循严格的 REST 协议。默认数据交换是通过 ...

版本说明

本文介绍时间序列数据库TSDB的Java SDK已发布的版本信息。TSDB的SDK采用开源的形态进行迭代开发,其代码托管在 Github。如果在使用过程中发现问题,推荐直接在Github上创建 Issue 进行反馈。我们也期待广大开发者为我们的SDK添砖加瓦。SDK...

专业术语

相反,当您向序列中写入一个新的数据点,并且该数据点的时间戳跟序列中某个数据点的时间戳相同,那么在该时间戳下的数据点的field set会变为旧field set和新field set的并集,以后访问这个数据点时,返回的都是修改后新的field set。...

常见问题参考

写入到TSDB的数据点是什么形态?默认情况下,当日志服务采集到的记录出现内容错误,或者因为类型不兼容等原因,无法正确转换为TSDB数据点时,数据导出任务会将对应的数据点字段设置为默认值(数值类型为0,字符串类型为空串,布尔类型为...

Quick BI如何接入TSDB

前提条件 已创建阿里云时间序列数据库实例。背景信息 为避免因数据源白名单限制导致数据对接访问失败,您需将Quick BI不同网络环境下的IP地址段添加至数据源的白名单中,更多对接配置详情请参见 设置网络白名单。操作步骤 验证数据源连接并...

ExploreHiTSDBInstanceData

描述 获取实例内的时间序列数据 请求参数 名称 类型 是否必需 描述 RegionId String 是 实例所在 Region ID InstanceId String 是 实例 ID ReverseIp String 是 实例反向 VPC IP ReversePort Integer 是 实例反向 VPC Port Metric String ...

常见问题

原因分析:utdid 是应用软件 ID,每次启动时都会取应用外的 utdid 和应用内的 utdid 进行比对,并使用生成时间比较早的 ID。首次安装时,没有外存储权限,所以无法获得应用外的 utdid,而且应用内又不存在 utdid,于是会生成一个 utdid。当...

管控类API概览

ExploreHiTSDBInstanceData 获取实例内的时间序列数据。ExploreHiTSDBInstanceDeletionJobList 获取删除任务记录列表,接口内根据JobType不同分别标识为数据删除任务或时间线删除任务。UpdateHiTSDBInstanceDataTtl 更新数据过期时间。

InfluxDB®️介绍

主要特点 InfluxDB®是您处理时序数据的一个绝佳选择,目前有以下特点:专为时间序列数据量身打造的高性能数据存储。TSM引擎提供数据高速读写和压缩等功能。简单高效的HTTP API写入和查询接口。针对时序数据,量身打造类似SQL的查询语言,...

错误反馈

什么调用API时提示:You have not opened Yundun Content Moderation Service?为什么本地测试正常,但是发布到ECS时报错:SDK.ServerUnreachable:Speicified endpoint or uri is not valid?为什么使用内容安全SDK报错:SDK....

离线人脸识别SDK

什么是离线人脸识别SDK 离线人脸识别SDK在Android设备终端集成,支持在弱网或离线环境下的人脸认证应用。离线人脸识别SDK包含人脸检测、活体检测、人脸1:1比对、人脸1:N检索、人脸库管理等能力,并全部离线化、本地化。SDK在授权激活后,可...

物联网设备数据上云存储

如何使用规则引擎转发数据到 TSDB 您可以通过在阿里云物联网平台的控制台上配置规则引擎将物联网平台中的数据转发到时间序列数据库(TSDB)的实例中。具体详情请参见 数据转发到实例内的时序数据存储。注意:目前发布的地域有“华东2”只...

【通知】TSDB实例停止售卖说明

TSDB实例停止售卖,如有需求,可购买云原生多模数据库Lindorm实例(下文简称Lindorm实例)。TSDB实例停止售卖时间 2022年02月 影响 如果您已购买TSDB实例,您可以正常...了解云原生多模数据库Lindorm,请参见 什么是云原生多模数据库Lindorm。

关键概念

什么索引很重要:Schema案例研究 假设您的大多数查询都是以field key butterflies 和 honeybees 的值作为过滤条件:SELECT FROM“census”WHERE“butterflies”=1SELECT FROM“census”WHERE“honeybees”=23 因为没有在field上建索引,...

结构比对

背景信息 ODC 的结构比对功能支持将同一项目下、同类型数据源的数据库对象结构进行对比分析,并生成变更脚本。本文档旨在介绍如何通过 ODC 提交结构比对工单以对比分析两个数据库对象结构。注意事项 链路支持:OceanBase MySQL 到 ...

管理序列

在 OceanBase 开发者中心(OceanBase Developer Center,ODC)单击连接名进入一个 Oracle 模式的连接后,在左导航栏中单击 序列 标签可以查看序列列表。您可以在序列列表中右键目标对象以进行一些 管理操作。或者,在序列列表中双击目标...
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