使用限制
应用诊断分析平台只提供分析诊断服务，不提供永久文件存储功能，会定期(7+天)清除您的文件，重要转储文件请务必提前使用OSS或其他方式存储 应用诊断分析平台免费提供50GB临时可用空间供您分析 应阿里云安全监管要求，为了最大程度保护用户...
应用问题诊断分析平台
应用诊断分析平台（Application Troubleshooting Platform，简称“ATP”）是一款分析功能丰富、诊断能力完备的平台，它可以帮助用户高效定位应用性能、异常行为、内存泄漏、程序崩溃等问题。
分析平台概述
Dataphin提供了简单、快速、高效的数据分析平台，您可通过数据分析对数据仓库中的数据进行洞察、在线查询及可视化分析，提取出有效信息而形成结论，辅助决策。前提条件 需开通智能研发版。分析平台简介 在分析平台上，您可选择您有权限的...
分析平台概述
Dataphin提供了简单、快速、高效的数据分析平台，您可通过数据分析对数据仓库中的数据进行洞察、在线查询及可视化分析，提取出有效信息而形成结论，辅助决策。前提条件 需开通智能研发版。分析平台简介 在分析平台上，您可选择您有权限的...
分析平台设置
Dataphin分析平台设置为使用分析平台的前提条件。包含分析平台专用的计算源设置、临时表生命周期设置、数据结果下载及审批设置。本文将为您介绍如何进行分析平台设置。前提条件 已完成计算源创建，具体操作，请参见 计算源概述。权限说明 ...
分析平台设置
Dataphin分析平台设置为使用分析平台的前提条件。包含分析平台专用的计算源设置、临时表生命周期设置、数据结果下载及审批设置。本文将为您介绍如何进行分析平台设置。前提条件 已完成计算源创建，具体操作，请参见 计算源概述。说明 分析...
查看并管理分析平台表
分析平台表是指您在分析平台专用计算源中用 create table 语句生成的表集合。分析平台表页面为您展示了分析平台表的基本信息及相关管理操作，方便您查看创建的分析平台表并进行管理。本文为您介绍分析平台表列表及支持的管理操作。权限说明...
查看并管理分析平台表
分析平台表是指您在分析平台专用计算源中用 create table 语句生成的表集合。分析平台表页面为您展示了分析平台表的基本信息及相关管理操作，方便您查看创建的分析平台表并进行管理。本文为您介绍分析平台表列表及支持的管理操作。权限说明...
什么是基因分析平台？
阿里云基因分析平台（Genomics Computing Platform）是用户友好的基因分析一站式平台，端到端地提供数据传输、存储管理、生物信息分析等核心能力。平台支持GA4GH社区开放标准，集成丰富的流程工具和公共数据集，帮助用户安全高效、敏捷弹性...
云原生数据湖分析（文档停止维护）
云原生数据湖分析（Data Lake Analytics，简称DLA）是无服务器（Serverless）化的数据湖分析服务，支持按需与保留资源使用，打造最具性价比的数据湖分析平台；提供一站式的数据湖分析与计算服务，支持 ETL、机器学习、流、交互式分析，可以...
入门概述
本文介绍开始使用基因分析平台前的准备工作，产品基本功能和使用流程，帮助您快速上手。准备工作 使用基因分析平台产品前，请确保您已经开通了阿里云账号并完成实名认证。相关操作参考如下：阿里云账号注册流程 个人实名认证 企业实名认证 ...
基因数据文件
本文介绍基因分析平台中基因数据文件的使用方法，包括上传、下载、删除等操作。基因分析平台并不直接提供基因数据的存储功能，而是依赖于阿里云 对象存储OSS 来帮助用户管理自己的基因数据文件。在开通基因分析平台时，由用户授权给基因...
基本概念
基因分析平台基础概念 基因分析平台的相关基础概念如下表所示：概念 说明 地域/region 基因分析平台中的数据文件、表格、应用以及运行等资源，都属于阿里云公共云上的某个地域，如 华北2（北京）。在用户进行基因计算时，这些资源也必须...
欠费说明
本文介绍基因分析平台产生欠费之后的服务状态和处理策略。如果您账户的可用额度（含阿里云账户余额、代金券、优惠券等）小于待结算的账单，即被判定为账户欠费。警告 当平台欠费后会影响正在执行的运行任务，系统会提醒或通知您，请及时...
常见问题
本文介绍基因分析平台的版本变更信息，包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。问：是否有用户需要的分析应用能够直接使用？答：基因分析平台通过应用仓库为用户提供开箱即用的公共应用，用户只需安装到工作空间即可使用。这部分...
工作空间
本文介绍基因分析平台中工作空间的使用方法。基因分析平台中的所有操作，都必须在工作空间内进行。用户可以通过工作空间进行基因数据、分析应用和运行任务的管理，满足数据隔离、权限控制、费用统计等业务需求。创建工作空间 在工作空间...
产品动态
本文介绍基因分析平台的版本变更信息，包括发布时间、版本变更内容、核心功能特性等信息。2021年5月 发布时间 版本变更内容 核心功能特性 2021-05-28 基因分析平台公测发布（北京、深圳地域首发）生信流程开发、版本化管理和计算分析，支持...
联系我们
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服务条款
阿里云基因分析平台（Genomics Computing Platform）的服务条款，请参见 阿里云产品服务协议。
设置运行时属性
本文介绍基因分析平台支持的运行时属性，并比较阿里云与其他计算后端的差别。基因分析平台目前使用WDL作为分析应用标准，用户可以通过每个Task中的runtime来定义计算作业所需要消耗的平台资源。平台支持的运行时属性 重要 基因分析平台运行...
使用本地IDE开发WDL流程应用
本文介绍了如何使用Visual Studio Code作为本地IDE，并安装WDL插件，来进行WDL流程的开发和测试，再发布到基因分析平台中。准备本地开发环境 访问 Visual Studio Code 官网，下载和安装完成后，再按照 WDL插件 到VSCode中，即可进行WDL流程...
应用场景
基因分析平台广泛用于基因数据从样本到报告的分析过程。典型应用场景包括基因数据分析、测序生产自动化和基因云平台开发等。基因数据分析 为任意规模用户，提供开箱即用的基因分析服务，效率高，成本低，灵活可靠，最快30分钟即可获取海量...
产品公告
本文介绍基因分析平台产品通知公告和活动信息。优惠通知 基因分析平台目前正式公测上线，为所有新用户提供按量付费7折的优惠活动，生效时间 从2021年6月1日开始到2021年11月31日结束。优惠后的产品定价信息如下：计费项 说明 公测优惠期间...
运行选项
本文介绍基因分析平台支持的运行选项，以及对分析结果的影响。Call-Caching Call-Caching是指当用户在基因分析平台中计算作业，被检测到与之前的执行记录一致，可以直接使用之前的计算结果而无需重新计算，可以节省时间和费用。简单来说，...
计费概述
本文介绍基因分析平台的计费模式、计费项、关联的其他云产品费用。概述 基因分析平台是阿里云托管的，完全Serverless化的基因计算服务。无需提前创建和管理任何集群，所有资源完全弹性按需，支持从0到千万的任意样本规模，且只需要为实际...
Sentieon
本文介绍了阿里云基因分析平台集成的第三方软件（Sentieon）的使用方法。关于Sentioen Sentieon® 成立于2014年，拥有算法、软件和系统调优的专业团队，开发了众多高度优化生物信息分析应用，获得precisionFDA组织的挑战赛的冠军，并在...
控制台快速开始
本文介绍如何通过产品控制台，在两分钟内快速完成一个基因分析任务，帮助用户熟悉基因平台基本操作。点击应用仓库中的 sentieon/dnaseq 公共应用。点击“安装运行”，选择已创建的工作空间，如默认创建的“default-workspace”，点击安装。...
查看消费明细
本文介绍基因分析平台相关的费用账单和消费明细。操作步骤 登录阿里云 管理控制台。单击顶部导航栏的“费用”，进入用户中心。在左侧导航栏根据需要，单击不同的标签页，查看消费情况。说明 按量付费资源，从资源使用到计费出账有一定延迟...
基因分析应用
本文介绍基因分析平台中的应用定义，如何在工作空间中创建、编辑和运行应用。基因数据分析工作，需要用户使用不同的生物信息学工具软件，进行一系列复杂的计算过程，才能得到最终的分析结果。以遗传病的数据分析举例，需要进行数据质控、...
基因实体表格
本文介绍基因分析平台中的实体概念，以及如何通过表格管理基因数据文件和元数据信息。基因实体表格介绍 基因数据除测序文件（如FASTQ，BAM等）外，还需要包括临床、样本、实验等相关元数据信息，这些组合在一起，才能形成生物医学多组学的...
使用限制
本文介绍基因分析平台功能相关的一些限制，以便您更好地使用。可用地域 基因分析平台支持的地域如下表所示，用户只能在可用地域内创建工作空间用于基因数据的管理和分析工作。地域 备注 华北2（北京）cn-beijing 华南1（深圳）cn-shenzhen ...
产品优势
阿里云基因分析平台是由阿里云完全托管，专门服务于基因测序行业的公有云产品。与传统的HPC集相比，无需任何前期投入，完全享有云计算敏捷灵活、按需付费和超大规模的优势。并且产品围绕基因行业的数据和应用特点，开发了众多专业能力，...
使用平台公共应用
本文介绍如何使用平台公共应用进行基因数据分析。基因分析平台的 应用仓库 提供了不同研究领域和分类的公共应用，这些都是权威的、经过验证的行业最佳实践，并且提供了常见的运行参数，真正的帮助用户实现开箱即用的基因数据分析。浏览公共...
管理运行任务
本文介绍如何在基因分析平台中查看、停止和恢复运行任务。用户在基因分析平台中成功创建运行任务后，系统会自动进行解析和执行，直到完成或者失败。在此过程中，用户可以随时查看运行任务的执行进度，任务日志和性能监控等情况。查看运行...
API概览
本产品（应用诊断分析平台/2022-06-06）的OpenAPI采用 ROA 签名风格，签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK，开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求...
准备工作
本文简单介绍分析前的准备工作 第一步：生成数据源 应用诊断分析平台（ATP）只提供 诊断分析 能力，需要您准备数据源以供分析。1.什么是数据源？取决于您想分析的应用问题，数据源有所不同。Q：发现GC频率过快？GC回收效率低下？应用出现...
应用模板
阿里云基因分析平台设计批量模式，不借助编程方式，通过控制台页面帮助用户一次性配置和运行多样本的分析任务，其核心是应用的批量运行模板。在应用的输入输出中，使用 实体表达式 来替代具体的数据，即可创建应用的运行模板。使用模板进行...
实体表达式
基因分析平台通过 基因实体表格 来管理基因数据文件，举例来说，某个生物样本（S001），其拥有多个属性值。FASTQ1单元格里的值，即为该样本存在对象存储OSS的原始序列文件。同时表格之间通过引用关系，来定义生物样本所从属的病人（NO...
ATP无权限报错
1.阿里云权限控制错误 如果用户遇到如下报错：没有权限，请联系主账号，在访问控制RAM中授予相应权限 说明用户没有访问应用诊断分析平台ATP的权限，需要联系主账号前往 访问控制RAM 添加 AliyunGraceFullAccess 权限。具体操作如下：进入 ...
创建编辑应用
用户可以在从头创建WDL应用，将本地或社区中的WDL应用迁移到基因分析平台中，并且为应用配置常用的分析运行参数。创建应用 提供应用基本信息 同一工作空间下的应用名称必须保持唯一，只能由数字、字母、下划线、连接符组成，长度不超过64个...
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