查看集群报表
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>报表。在顶部下拉列表中，选择目标集群。查看报表。查看集群节点数量。节点数量展示集群中节点数量的变化折线图，支持显示各队列...
Gromacs Ehpc计算巢快速部署文档
权限策略名称 备注 AliyunECSFullAccess 管理云服务器服务（ECS）的权限 AliyunEHPCFullAccess 管理弹性高性能计算（EHPC）的权限 AliyunNASFullAccess 管理文件存储（NAS）的权限 AliyunVPCFullAccess 管理专有网络（VPC）的权限 ...
创建集群
计算节点：用于执行高性能计算作业的节点，其配置决定了E-HPC集群的总体性能。管控节点：用于进行作业调度和域账号管理的节点。登录节点：默认绑定弹性公网IP，您可远程登录该节点，通过命令行操作集群。展开高级配置，配置网络、存储等...
AutoDock Vina Ehpc计算巢部署文档
权限策略名称 备注 AliyunECSFullAccess 管理云服务器服务（ECS）的权限 AliyunVPCFullAccess 管理专有网络（VPC）的权限 AliyunROSFullAccess 管理资源编排服务（ROS）的权限 AliyunEHPCFullAccess 管理弹性高性能计算（EHPC）的权限 ...
创建混合云集群
您可以利用本地的HPC集群在阿里云扩容计算节点资源，统一调度云上资源和您的本地资源进行高性能计算。本文介绍如何通过E-HPC管理控制台创建混合云集群。前提条件 已创建专有网络VPC和交换机。具体操作，请参见 创建专有网络 和 创建交换机...
镜像关联
背景信息 服务商需要根据服务的镜像规划，在模板中写入ECS实例、ECS实例组、ESS伸缩组或弹性高性能计算E-HPC的镜像ID属性。计算巢会从模板中解析出所有的镜像ID，服务商仅需将源镜像与所选的部署物关联，在创建服务实例时，会根据服务实例...
LAMMPS Ehpc服务实例部署文档
权限策略名称 备注 AliyunECSFullAccess 管理云服务器服务（ECS）的权限 AliyunVPCFullAccess 管理专有网络（VPC）的权限 AliyunROSFullAccess 管理资源编排服务（ROS）的权限 AliyunEHPCFullAccess 管理弹性高性能计算（EHPC）的权限 ...
创建带有插件的集群
使用控制台创建带有插件的集群 创建不同接入模式集群的操作如下：Image接入模式 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面右上角，单击 创建集群。根据自身业务场景进行设置，在...
AlphaFold2 Ehpc计算巢快速部署文档
权限策略名称 备注 AliyunECSFullAccess 管理云服务器服务（ECS）的权限 AliyunEHPCFullAccess 管理弹性高性能计算（EHPC）的权限 AliyunNASFullAccess 管理文件存储（NAS）的权限 AliyunVPCFullAccess 管理专有网络（VPC）的权限 ...
使用AutoDock Vina软件进行药物筛选
本文以AutoDock Vina软件为例，介绍如何在E-HPC上进行高性能计算实现虚拟药物筛选。背景信息 分子对接（Molecular docking）是虚拟药物筛选中的关键环节。AutoDock Vina作为一款开源的分子对接软件，具有速度快、算法准确等优点，特别适用...
使用LAMMPS软件进行工业仿真
vim lammps.pbs 作业脚本内容示例如下：说明 以下示例使用1个计算节点的32 vCPU，使用32个MPI任务进行高性能计算。请根据实际计算节点规格配置vCPU数，算力要求vCPU≥32。bin/sh#PBS-l select=1:ncpus=32:mpiprocs=32#PBS-j oe export ...
通过控制台提交作业
作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元，包括Shell脚本、可执行文件等，具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能，本文介绍如何使用E-HPC...
弹性高性能计算E-HPC的审计事件
弹性高性能计算E-HPC已与操作审计服务集成，您可以在操作审计中查询用户操作弹性高性能计算产生的管控事件。操作审计支持将管控事件投递到日志服务SLS的LogStore或对象存储OSS的存储空间中，满足实时审计、问题回溯分析等需求。操作审计...
使用GROMACS进行分子动力学模拟
通过控制台 在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作，请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中，选择 Application>System Tools>Terminal。运行/...
使用IMB软件和MPI通信库测试集群通信性能
MPI_DEBUG 5-np 2-ppn 1-host compute000,compute001/opt/intel-mpi-benchmarks/2019/IMB-MPI1 pingpong>IMB-pingpong#请根据实际调整参数 脚本示例使用2个计算节点，每个节点为8 vCPU，使用一个MPI任务进行高性能计算。实际测试中请根据...
创建作业
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在 集群 页面，找到gromacs-test集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入gmx.test的用户名、密码和节点端口，单击 ssh连接。下载并解压算例。说明 本算例为模拟...
通过钉钉机器人发送事件通知
E-HPC支持的事件信息请参见 弹性高性能计算E-HPC事件。在 配置事件目标 页面，参考参数说明完成配置，单击 创建。首次操作时，需完成服务授权，允许阿里云事件总线访问审计日志。参数说明如下：服务类型：选择 钉钉。地址：填入钉钉机器人...
管理共享存储
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>共享存储。在页面上方选择目标集群，然后单击 资源管理 页签。在 资源管理 页签下，单击 挂载存储资源。在弹出面板，完成参数配置，然后单击 ...
使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入集群用户名、登录密码和端口，单击 ssh连接。步骤二：运行算例 ...
扩容混合云集群
普通扩容 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，选择需要扩容的混合云集群，单击 扩容。在 集群扩容 面板，单击 普通扩容 页签，配置扩容参数。配置项 说明 可用区 扩容...
授权信息
本文为您介绍 弹性高性能计算（Ehpc）为RAM权限策略定义的操作（Action）、资源（Resource）和条件（Condition）。弹性高性能计算（Ehpc）的RAM代码（RamCode）为 ehpc，支持的授权粒度为 OPERATION。权限策略通用结构 权限策略支持JSON...
提交作业
作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元，包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前，您需要准备好作业文件，并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件：通过...
手动扩容集群
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到需要扩容的集群，单击 扩容。在 集群扩容 面板，完成节点配置。扩容时，支持添加新建节点、已有节点或线下节点，请根据需要选择...
客户端功能概述
作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算。E-HPC客户端主要面向作业操作员，支持作业提交、作业文件管理等功能。具体功能如下：功能模块 说明 作业查询 支持按多种条件查询作业数据，以便调整作业任务。作业提交 支持通过界面、...
E-HPC普通服务角色
通过AliyunECSInstanceForEHPCRole，ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色，必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一：授予...
基于RDMA增强型实例部署HPC应用
步骤一：准备HPC集群 使用弹性高性能计算创建HPC集群以及用户。登录 弹性高性能计算控制台。创建HPC集群。在 集群 页面右上角，单击 创建集群。按向导顺序逐步完成硬件、软件、基本配置。本文示例配置如下表所示，完整配置项的说明，请参见...
在Serverless集群中提交作业
创建Serverless集群后...在 弹性高性能计算控制台 的 作业 页面，选择目标集群后，单击 作业列表 页签。在该页面可以设置状态、时间段等条件查询作业信息。在 弹性容器实例控制台 的 容器组 页面，可以查看自动创建的用于运行作业的ECI实例。
设置调度器参数
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>调度器。在 集群 列表选择目标集群，在 调度器 列表选择调度器。设置调度器配置信息，然后在页面右上角，单击 提交。Slurm 如果是Slurm调度器，...
镜像使用说明
您可以快速开始使用GPU进行高性能计算。这些官方基础镜像已经预先配置好了相应的环境和依赖，可以直接使用，省去繁琐的安装和配置过程。您可以在构建业务逻辑时使用这些镜像，以此提高应用的性能和可靠性。以下是 函数计算 GPU提供的基础...
使用Schrodinger软件计算分子结构
在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作，请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中，选择 Application>System Tools>Terminal。运行/opt/vmd/1.9....
使用向导创建集群
建议您通过弹性高性能计算管理控制台操作。步骤一：配置硬件信息 创建集群时，您必须配置集群的硬件信息。硬件决定了集群的性能，包括集群所处地域、集群部署方式、不同类型节点数量、网络类型、共享存储等。您可以根据您的业务需求选择...
配置集群巡检
配置集群巡检 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 运维与监控>集群巡检。在集群列表中选择目标集群，然后单击 创建巡检。在弹出的对话框中，完成巡检配置。输入名称和描述。选择巡检执行方式...
通过命令行提交作业
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入集群用户名、登录密码和端口，单击 ssh连接。提交作业 请根据集群...
使用Environment Modules管理软件包
module load：加载模块 module unload：卸载模块 module list：显示已经加载的模块 操作步骤 以下通过Environment Modules软件卸载openmpi/3.0.0，然后加载openmpi/3.0.1版本示例来介绍如何设置modulefile：登录 弹性高性能计算控制台。...
创建以CPFS为共享存储的E-HPC集群
背景信息 CPFS（Cloud Paralleled File System）是一种高性能并行文件存储系统，专为AI训练和E-HPC等高性能计算场景打造，最大支持数十GB/s吞吐能力。CPFS的数据存储在集群中的多个数据节点，并可由多个客户端同时访问，从而能够为大型E-...
MemVerge Memory Machine部署使用实践
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面右上角，单击 创建集群。在 硬件配置 页，完成硬件配置，然后单击 下一步。配置硬件时，由于Memory Machine基于Intel Optane PMEM，...
镜像使用说明
您可以快速开始使用GPU进行高性能计算。这些官方基础镜像已经预先配置好了相应的环境和依赖，可以直接使用，省去繁琐的安装和配置过程。您可以在构建业务逻辑时使用这些镜像，以此提高应用的性能和可靠性。以下是 函数计算 GPU提供的基础...
常见问题
弹性高性能计算服务关联角色（AliyunServiceRoleForEHPC）是访问控制提供的一种服务关联角色，用于授权E-HPC访问关联云资源。通过AliyunServiceRoleForEHPC，E-HPC可以获得云服务器ECS、专有网络VPC、文件存储NAS等阿里云产品的访问权限。...
API概览
本产品（弹性高性能计算/2018-04-12）的OpenAPI采用 RPC 签名风格，签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK，开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求，...
配置自动伸缩
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 弹性>自动伸缩。在 自动伸缩 页面，从集群列表中选择需要配置自动伸缩的集群。在 全局配置 区域完成参数配置。配置项 描述 开关设置 为集群内所有队列开启...
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