应用场景
基因分析平台广泛用于基因数据从样本到报告的分析过程。典型应用场景包括基因数据分析、测序生产自动化和基因云平台开发等。...基因分析平台强大的计算引擎可以保证企业云平台安全可靠，稳定高性能，满足大规模生产和应用要求。
创建用户
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>用户。在 用户 页面，在集群列表中选择目标集群，单击 新增用户。在 新增用户 页面，根据提示填写用户信息。参数 示例 描述 用户名 gmx...
释放集群
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，选择需要释放的集群，单击 更多>释放。在弹出的 删除集群 对话框，单击 确认。集群将进入 释放中 状态，释放完成后集群列表...
使用BWA、GATK、Samtools软件进行基因测序
高性能计算可以提供强大的算力支持，使用多种调度器提高并发效率，使用GPU进行计算加速等。本文以经典及普及的二代全基因组测序WGS（Whole Genome Sequencing）流程为例，结合二代测序软件GATK，介绍人类全基因组测序的通用流程。在实际...
查看作业结果
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业与性能管理>作业。单击目标作业列表右侧 详情，可以查看作业详细信息。查看作业性能指标。在左侧导航栏，选择 作业 与性能 管理>E-HPC优化器...
授权信息
本文为您介绍 弹性高性能计算（Ehpc）为RAM权限策略定义的操作（Action）、资源（Resource）和条件（Condition）。弹性高性能计算（Ehpc）的RAM代码（RamCode）为 ehpc，支持的授权粒度为 OPERATION。权限策略通用结构 权限策略支持JSON...
管理队列
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>节点与队列。在 集群 列表中选择目标集群。在 节点类型 列表中选择计算节点。按照需要进行以下操作。创建新的队列 单击打开 队列 下拉列表，然后...
更新ehpcutil版本
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 详情。在 集群详情 页面底部的 ehpcutil版本信息 区域，根据需要进行升级或者回退操作。如果当前...
修复集群
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，选择待修复集群，单击 更多>修复。在弹出的 集群修复 页面，重新指定待修复集群的 镜像类型、镜像、调度器 和 域账号服务。...
监控存储资源
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 资源管理>共享存储。在 共享存储 页面，选择目标集群，单击 资源 监控 页签。在 资源监控 页签下，设置并查看存储资源的相关监控数据。配置项 说明 文件...
查看E-HPC操作日志
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 运维与监控>操作日志。在 集群 列表中选择目标集群。根据需要设置查询条件，单击 图标。查询条件说明如下：查询条件 说明 时间范围 快速选择：可...
管理作业模板
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 作业 与性能 管理>作业。在 作业 页面，选择待创建作业模板的集群。单击页面左侧的 提交作业 页签。在 提交作业 区域，完成作业参数配置，单击 图标将当前...
创建带有插件的集群
使用控制台创建带有插件的集群 创建不同接入模式集群的操作如下：Image接入模式 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面右上角，单击 创建集群。根据自身业务场景进行设置，在...
创建集群
操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，单击 创建集群。说明 下文采用最简配置介绍如何快速创建一个集群。部分未提及的配置保持默认选项。更多信息，请参见 使用...
创建混合云集群
您可以利用本地的HPC集群在阿里云扩容计算节点资源，统一调度云上资源和您的本地资源进行高性能计算。本文介绍如何通过E-HPC管理控制台创建混合云集群。前提条件 已创建专有网络VPC和交换机。具体操作，请参见 创建专有网络 和 创建交换机...
在GPU集群中加速AI模型训练
文件存储CPFS 阿里云推出的全托管、可扩展并行文件系统，满足高性能计算场景的需求。CPFS提供了统一的命名空间，支持成百上千的机器同时访问，拥有数十GB的吞吐、数百万的IOPS能力的同时还能保证亚毫秒级的延时。最佳实践详情 使用容器服务...
基因计算
文件存储NAS具备高吞吐量、读写一致性及低延迟的文件操作能力，为基因分析的大规模数据提供了高性能的存储载体。本文列举了基因计算的最佳实践案例。基因行业容器存储解决方案 EHPC实现药物筛选解决方案最佳实践 基因计算工作流实战
弹性高性能计算E-HPC的审计事件
弹性高性能计算E-HPC已与操作审计服务集成，您可以在操作审计中查询用户操作弹性高性能计算产生的管控事件。操作审计支持将管控事件投递到日志服务SLS的LogStore或对象存储OSS的存储空间中，满足实时审计、问题回溯分析等需求。操作审计...
应用场景
大规模分布式训练 高性能打造AI进化底座。超大规模GPU算力系统，全对等网络架构，全资源池化，可以搭配PAI（机器学习平台）使用，支持多种训练框架（Pytorch、TensorFlow、Caffe、Keras、Xgboost、Mxnet等），可以满足多种规模的AI训练和...
通过钉钉机器人发送事件通知
温馨提醒您的账户于${createTime} 在${regionId} 地域在弹性高性能计算集群${clusterName}(${clusterId})上进行节点扩容，操作信息如下：\t可用区ID：${zoneId} \t交换机ID：${vSwitchId} \t镜像ID：${imageId} \t实例类型：${instanceType...
授权信息
本文为您介绍 弹性高性能计算（Ehpc）为RAM权限策略定义的操作（Action）、资源（Resource）和条件（Condition）。弹性高性能计算（Ehpc）的RAM代码（RamCode）为 ehpc，支持的授权粒度为 OPERATION。权限策略通用结构 权限策略支持JSON...
使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入集群用户名、登录密码和端口，单击 ssh连接。步骤二：运行算例 ...
客户端功能概述
作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算。E-HPC客户端主要面向作业操作员，支持作业提交、作业文件管理等功能。具体功能如下：功能模块 说明 作业查询 支持按多种条件查询作业数据，以便调整作业任务。作业提交 支持通过界面、...
E-HPC普通服务角色
通过AliyunECSInstanceForEHPCRole，ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色，必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一：授予...
使用Environment Modules管理软件包
module load：加载模块 module unload：卸载模块 module list：显示已经加载的模块 操作步骤 以下通过Environment Modules软件卸载openmpi/3.0.0，然后加载openmpi/3.0.1版本示例来介绍如何设置modulefile：登录 弹性高性能计算控制台。...
配置集群巡检
配置集群巡检 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，选择 运维与监控>集群巡检。在集群列表中选择目标集群，然后单击 创建巡检。在弹出的对话框中，完成巡检配置。输入名称和描述。选择巡检执行方式...
通过命令行提交作业
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入集群用户名、登录密码和端口，单击 ssh连接。提交作业 请根据集群...
使用Schrodinger软件计算分子结构
在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作，请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中，选择 Application>System Tools>Terminal。运行/opt/vmd/1.9....
ECU详解
ECU分类 分析型数据库MySQL版中有高性能和大存储两种类型的ECU。高性能：以字母C或者H开头的ECU为高性能实例，数据全部存储在SSD磁盘中。适用于对性能要求高、查询并发高的业务场景。大存储：以字母S开头的ECU为大存储实例，采用SSD/HDD...
什么是弹性高性能计算E-HPC
弹性高性能计算将计算能力积聚，用并行计算方式解决更大规模的科学、工程和商业问题，在科研机构、石油勘探、金融市场、气象预报、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。产品架构 弹性高性能计算的产品架构如下图所示。弹性...
GPU计算型
主售（推荐类型）GPU计算型实例规格族gn7e GPU计算型实例规格族gn7i GPU计算型实例规格族gn7s GPU计算型实例规格族gn7 GPU计算型实例规格族gn7r GPU计算型实例规格族gn6i GPU计算型实例规格族gn6e GPU计算型实例规格族gn6v GPU计算型弹性裸...
使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处，选择地域。在左侧导航栏，单击 集群。在 集群 页面，找到目标集群，单击 远程连接。在 远程连接 页面，输入集群用户名、登录密码和端口，单击 ssh连接。步骤二：编译LAMMPS ...
创建以CPFS为共享存储的E-HPC集群
本文介绍如何创建以CPFS为共享存储的高性能计算集群，为您提供一个高IOPS、高吞吐、低时延的计算集群。背景信息 CPFS（Cloud Paralleled File System）是一种高性能并行文件存储系统，专为AI训练和E-HPC等高性能计算场景打造，最大支持数十...
混合存储型（已停售）
使用混合存储型，将所有课程信息存储到磁盘，访问量大的课程和题库数据存储到内存并常驻内存，保证高频访问数据的读写性能，实现高性能与高性价比的有机结合。典型业务场景的示例如下：场景1：使用开源Redis集群存储了100 GB的数据，但高峰...
米哈游
如何实现大规模数据场景下的高性能查询分析成为《原神》团队迫切需要解决的问题。集中采集 除在中国市场广受欢迎外，《原神》在海外市场同样火爆，荣登美国、德国、加拿大、韩国、新加坡等国家APP Store畅销榜榜首。然而全球化也带来了数据...
弹性网卡概述
您可以使用eRDMA弹性网卡将线下的RDMA应用平滑迁移到云上，获取成本更低、弹性更好的高性能RDMA服务，例如高性能计算、AI训练、大数据处理等。更多信息，请参见 eRDMA概述。弹性网卡数量较多时，您可以通过标签服务来分组管理。更多信息，...
ECS选型最佳实践
高性能计算？异构计算？企业级实例是阿里云2016年9月开始推出的一系列实例规格族的总称，具有高性能、稳定计算能力和平衡网络性能的特点。因为具有独享且稳定的计算、存储、网络资源，这些实例规格族非常适合对业务稳定性具有高要求的企业...
运行HPL、iPerf和FIO以测试集群性能
HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高性能计算集群的浮点计算能力。iPerf：一个网络性能测试工具，支持设置协议、时间等相关参数，可以报告带宽、数据包丢失等。FIO：一个开源的I/O压力测试...
大数据型
网络：实例网络性能与计算规格对应（规格越高网络性能越强）适用场景：Hadoop MapReduce、HDFS、Hive、HBase等 Spark内存计算、MLlib等 互联网行业、金融行业等有大数据计算与存储分析需求的行业客户，进行海量数据存储和计算的业务场景 ...
PAI灵骏智算服务概述
PAI灵骏 是一种大规模高密度计算服务，全称“PAI灵骏智算服务”，提供高性能AI训练、高性能计算所需的异构计算算力服务。PAI灵骏 主要面向图形图像识别、自然语言处理、搜索广告推荐、通用大模型等大规模分布式的AI研发场景，适用于自动...
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