EHPC药物筛选
场景描述 本方案适用于使用弹性高性能计算 EHPC和文件存储NAS来搭建基础环 境，运行药物筛选应用AutodockVina 的场景中，这里采用批处理方式来提交 作业，并可以可视化计算结果。 方案架构 1.计算之前，将数据通过互联网/闪电立方/高速通道上传到阿里云OSS 2.计算时，将数据从OSS拉取到文件共享存储NAS上 3.计算时，在EHPC集群上进行，计算节点从NAS上读写数据 • 容量型NAS：低成本，大容量 • 性能型NAS：适合高IOPS应用，作为临时目录 • CPFS：适合超大规模，并行度极高的作业 4.计算节点： • 如果对计算时间不敏感，希望低成本运算，可选ECS实例 • 如果时效性要求高，建议采用SCC超级计算集群 5.可视化 • 如果可视化部分计算量不大，可以采用EHPC自带的可视化服务 解决问题 1.使用EHPC运行药物筛选应用 2.使用nas存储计算数据 3.使用OSS保存计算结果 • 通过分子对接（moleculardocking）模拟计算进行药物筛选，是模拟小分子配体和生物大分子受体的 相互作用，预测配体和受体的结合模式和亲和力。 • 通常，有很多已有的配体库，如商业化的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库。提供大量配体，模 拟计算就是计算这些配体和给定受体的相互作用。 • 每次模拟计算通常处理一个配体和一个受体，不同配体之间没有依赖，因此可以同时大规模并行处 理。 本解决方案同样适用于有批量、高并发处理需求的其它生物、医药等场景。 产品列表 弹性高性能计算E-HPC 文件存储NAS 对象存储OSS
名词解释 弹性高性能计算（E-HPC）基于阿里云基础设施，为用户提供一站式公共云 HPC/AI 平台服务，面向科研，生产，教育和行业大计算，提供快捷，弹性，安全和与阿里云 产品互通的云超算平台。详见 https://www.aliyun.com/product/ehpc 文件存储 NAS，阿里云文件存储 NAS是一个可共享访问，弹性扩展，高可靠，高 性能的...
基于云速搭CADT快速构建药物筛选批量计算环境-serverless版
本方案基于云速搭 CADT提供一个快速构建云上Serverless版HPC批量计算环境的模板，针对生物制药领域的药物筛选场景，提供开箱即用的整套解决方案工具包，整个云上环境仅需1个小时即可完成自动化部署搭建。
产品介绍 弹性高性能计算（E-HPC）：基于阿里云基础设施，为用户提供一站式公共云 HPC/AI 平台服务，面向科研，生产，教育和行业大计算，提供快捷，弹性，安全和与阿里 文档版本：20240204 2 基于云速搭 CADT部署药物筛选批量计算环境-Serverless版 最佳实践概述 云产品互通的云超算平台。文件存储 NAS：阿里云文件存储 NAS...
EHPC混合云渲染
介绍在混合云环境下，利用E-HPC及其文件缓存机制，无缝读取线下存储中的项目资产，免去复杂繁琐的文件同步问题；充分利用云上资源弹性、按使用付费的优势，构建高性能、高可靠和可扩展的渲染服务。 解决问题 l混合云环境下本地集群与云端集群一体化的渲染服务。 l避免繁琐复杂的本地与云端的文件同步问题。 l低成本、高效率应对渲染业务峰值。 产品列表 l云服务器、GPU云服务器 l高性能计算E-HPC l专有网络VPC l云企业网CEN l弹性公网IP EIP l访问控制RAM l文件存储NAS
名词解释 E-HPC：弹性高性能计算（E-HPC）基于阿里云基础设施，为用户提供一站式公 共云 HPC/AI平台服务，面向科研，生产，教育和行业大计算，提供快捷，弹性，安全和与阿里云产品互通的云超算平台。NAS：阿里云文件存储 NAS是一个可共享访问，弹性扩展，高可靠，高性能的 分布式文件系统。兼容 POSIX 文件接口，可支持数千...
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