R语言用隐马尔可夫Profile HMM模型进行生物序列分析和模拟可视化
原文链接:http://tecdat.cn/?p=27258 摘要 本文开发和应用用于生物序列分析的隐马尔可夫模型和HMM。它包含多个和成对序列比对、模型构建和参数优化、文件导入/导出、实现条件序列概率的前向、后向和 Viterbi 算法、基于树的序列加权和序列模拟的功能。 相关视频 介...
R语言中的隐马尔可夫HMM模型实例
最近,我们使用隐马尔可夫模型开发了一种解决方案,并被要求解释这个方案。 HMM用于建模数据序列,无论是从连续概率分布还是从离散概率分布得出的。它们与状态空间和高斯混合模型相关,因为它们旨在估计引起观测的状态。状态是未知或“隐藏”的,并且HMM试图估计状态,类似于无监督聚类过程。 例子 在介绍HMM背...
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