R语言中如何进行PCA分析？利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图（下）
PCA的实现流程使用上面创建的data_3数据来进行后续操作。首先生成表达矩阵，包含3个基因在200个样本中的表达情况。> kable(headTail(data_3),booktabs=T,caption = "Expression 3Gene in 200 samples") Table:...
R语言中如何进行PCA分析？利用ggplot和prcomp绘制基因表达量分析图（上）
学习笔记的主要内容是在R语言中利用ggplot2进行PCA分析和绘图，包括简单分析与操作流程，对比不同方式得到的结果差异，提供脚本代码供练习（下载链接见文末）PCA分析的原理在处理基因差异表达数据时，有时候需要分析其中因素的影响最大，判断结果的关系，这个时候可以用PCA分析法ÿ...
跟着PNAS学作图：R语言ggplot2花瓣图展示泛基因组分析中核心和可变基因
论文Evolutionary history and pan-genome dynamics of strawberry (Fragaria spp.)https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2105431118草莓PNAS.pdf今天的推文我们复现一下...
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